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以2个细胞质不育相关基因orfH79和orf290特异分子标记辅助选择,从102份AA基因组的野生稻和824个栽培稻品系中筛选并构建了与YTA同核异质的新型胞质纯合不育系L-orfH79和初步纯合的不育系L-orf290材料。以3个与YTA同核同质的近等基因恢复系L-Rf5、L-Rf6、L-Rf5-6对2个新型胞质不育系恢复的遗传效应的进行了初步分析,取得以下结果:
1. Southern Blot对13个L-orf290(BC4F1)候选材料进行分析,证实13个材料只含orf290,不含有orfH79;在13个L-orf290候选材料中,以YTB为轮回父本的回交 BC4F1与 BC3F1的花粉育性、套袋结实率和自然结实率相比, L-orf290候选材料z597和z604育性降低明显,其它材料育性变化不明显。以Rf5和Rf6相关的特异分子标记对13个候选材料进行鉴定,未发现含有恢复基因Rf5和Rf6,但有rf5和rf6,证实13个L-orf290候选材料的BC4F1育性高低可能与Rf5和Rf6没有相关性。在13个L-orf290候选材料的BC4F1中,orf290的表达量均较 YTA低,且Ⅷ期幼穗和同时期剑叶中的表达量无显著差异。克隆13个L-orf290候选材料(BC4F1)的orf290,序列比对分析结果显示除其下游区有T-A和A-T两个碱基变化外,在ORF区与不育系YTA没有差异,但转录后是否存在基因编辑,尚需进一步证实。
2.以新型胞质不育系L-orfH79为母本,分别与L-Rf5、L-Rf6以及L-Rf5-6进行杂交,后代进行套袋自交至F4代,以rf5、Rf5、rf6和Rf6基因特异的分子标记对近等基因恢复系和 L-orfH79/L-Rf杂种 F4代植株进行鉴定表明,与 YTA同核同质的近等基因恢复系 L-Rf5、L-Rf6和 L-Rf5-6没有 rf5和 rf6,而L-orfH79/NIL-Rf的 F4代大多数植株也不含含有 rf5和 rf6。对近等恢复系和L-orfH79/NIL-Rf的F4代植株的花粉育性、套袋结实率和orfH79转录本表达量的统计分析表明,不育系L-orfH79导入恢复基因后,orfH79 mRNA的表达量降低,育性得到恢复且稳定遗传。
3.利用 CRISPR/Cas9系统的特异性及定位编辑的特性对近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6中的Rf5和Rf6进行基因编辑。根据水稻Rf5和Rf6的序列,针对Rf5和 Rf6外显子区域设计3对合适靶标位点的目的序列,构建了pC1300-Cas9-Rf5A、pC1300-Cas9-Rf5B和pC1300-Cas9-Rf6载体,通过农杆菌介导转化近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6。对3种转基因植株的编辑率的统计表明, T0-Cas9-L-Rf6转基因植株的编辑率为79.17%,T0-Cas9-L-Rf5B转基因植株的编辑率为84.58%, T0-Cas9-L-Rf5A转基因苗小,其编辑率尚待以后统计。对T0-Cas9-L-Rf6和T0-Cas9-L-Rf5B花粉育性的初步观察表明,T0-Cas9-L-Rf6的植株的花粉育性明显降低,但结实率仍较高;T0-Cas9-L-Rf5B的植株的花粉育性和结实率均降低,但对近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6中Rf5和Rf6基因编辑的效应,尚需对其后代的花粉育性和结实率进一步观察统计验证。
1. Southern Blot对13个L-orf290(BC4F1)候选材料进行分析,证实13个材料只含orf290,不含有orfH79;在13个L-orf290候选材料中,以YTB为轮回父本的回交 BC4F1与 BC3F1的花粉育性、套袋结实率和自然结实率相比, L-orf290候选材料z597和z604育性降低明显,其它材料育性变化不明显。以Rf5和Rf6相关的特异分子标记对13个候选材料进行鉴定,未发现含有恢复基因Rf5和Rf6,但有rf5和rf6,证实13个L-orf290候选材料的BC4F1育性高低可能与Rf5和Rf6没有相关性。在13个L-orf290候选材料的BC4F1中,orf290的表达量均较 YTA低,且Ⅷ期幼穗和同时期剑叶中的表达量无显著差异。克隆13个L-orf290候选材料(BC4F1)的orf290,序列比对分析结果显示除其下游区有T-A和A-T两个碱基变化外,在ORF区与不育系YTA没有差异,但转录后是否存在基因编辑,尚需进一步证实。
2.以新型胞质不育系L-orfH79为母本,分别与L-Rf5、L-Rf6以及L-Rf5-6进行杂交,后代进行套袋自交至F4代,以rf5、Rf5、rf6和Rf6基因特异的分子标记对近等基因恢复系和 L-orfH79/L-Rf杂种 F4代植株进行鉴定表明,与 YTA同核同质的近等基因恢复系 L-Rf5、L-Rf6和 L-Rf5-6没有 rf5和 rf6,而L-orfH79/NIL-Rf的 F4代大多数植株也不含含有 rf5和 rf6。对近等恢复系和L-orfH79/NIL-Rf的F4代植株的花粉育性、套袋结实率和orfH79转录本表达量的统计分析表明,不育系L-orfH79导入恢复基因后,orfH79 mRNA的表达量降低,育性得到恢复且稳定遗传。
3.利用 CRISPR/Cas9系统的特异性及定位编辑的特性对近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6中的Rf5和Rf6进行基因编辑。根据水稻Rf5和Rf6的序列,针对Rf5和 Rf6外显子区域设计3对合适靶标位点的目的序列,构建了pC1300-Cas9-Rf5A、pC1300-Cas9-Rf5B和pC1300-Cas9-Rf6载体,通过农杆菌介导转化近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6。对3种转基因植株的编辑率的统计表明, T0-Cas9-L-Rf6转基因植株的编辑率为79.17%,T0-Cas9-L-Rf5B转基因植株的编辑率为84.58%, T0-Cas9-L-Rf5A转基因苗小,其编辑率尚待以后统计。对T0-Cas9-L-Rf6和T0-Cas9-L-Rf5B花粉育性的初步观察表明,T0-Cas9-L-Rf6的植株的花粉育性明显降低,但结实率仍较高;T0-Cas9-L-Rf5B的植株的花粉育性和结实率均降低,但对近等基因恢复系L-Rf5和L-Rf6中Rf5和Rf6基因编辑的效应,尚需对其后代的花粉育性和结实率进一步观察统计验证。