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背景:近年来肺腺癌发病率逐步升高,其治疗模式已迈入以基因分型为指导的精准医学时代,诸如EGFR、ALK基因突变患者取得了较好的临床效果,但突变人群阳性率偏低,患者总体5年生存率仍徘徊在20%左右。因此,深入探索肺腺癌发生、发展的分子机制,了解其诊疗特异性靶标是肺癌研究领域的热点问题。环状RNA(circularRNA,circRNA)是有别于传统线性RNA的一类新型非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA),越来越多的研究提示circRNA可作为诸多恶性肿瘤的生物学标志物,并成为治疗的潜在靶标。因此从circRNA角度挖掘肺腺癌新型分子靶标,将有助于揭示肺腺癌发生发展新机制,并为临床诊疗提供新思路。
方法:本研究首先通过高通量芯片测序技术,从肺腺癌患者手术标本(癌与癌旁配对组织)中获取差异表达的circRNA,结合已有生物信息学数据库,鉴定筛选出一个在肺腺癌组织中显著高表达的circRNA即circ_0007766。随后,在肺腺癌组织样本中验证了circ_0007766与肺腺癌患者临床病理特征及预后的相关性。进一步,通过体外实验对circ_0007766的生物学功能进行验证。最终,对circ_0007766促进肺腺癌增殖的相关机制进行初步探索。
结果:通过高通量芯片筛查差异表达cirRNA,对芯片结果进行KEGG及GO分析后发现共有194条circRNA与肺腺癌恶性特性相关,进一步与数据库进行比对,共筛出5条差异表达circRNA。结合肺腺癌患者临床病理特征及预后资料,发现circ_0007766表达的均一性最好,且其表达量与肺腺癌分期及预后呈正相关,即circ_0007766表达越高,肺腺癌分期越高,患者预后越差。随后,我们设计了circ_0007766的特异性siRNA,体外细胞功能学实验结果表明干扰circ_0007766可以显著抑制肺腺癌细胞的增殖。通过生物信息学方法预测结合RIP实验验证,发现circ_0007766可与eIF4A3蛋白结合,eIF4A3蛋白作为eIF4A(eukaryotictranslationinitiationfactor4F,真核翻译起始因子4F)家族成员之一,可与靶mRNA结合,并通过无义介导的mRNA降解途径(nonsense-mediatedmRNA decay,NMD)在转录后水平调控细胞周期关键蛋白CyclinD1/CyclinE1/CDK4的表达,进而调控肺腺癌细胞的增殖。
结论:本研究通过高通量芯片筛查并结合数据库和临床样本资料验证,鉴定出一条与肺腺癌临床及预后呈正相关的环状RNA分子即circ_0007766。体外功能学研究表明circ_0007766可促进肺腺癌细胞增殖,进一步的分子机制研究发现circ_0007766可通过招募eIF4A3蛋白,从而上调细胞周期关键蛋白CyclinD1/CyclinE1/CDK4的表达,进而促进肺腺癌恶性增殖。本研究以circRNA为视角,将对肺腺癌发生发展机理及预后判断提供新线索,为临床治疗应用提供新靶标。
方法:本研究首先通过高通量芯片测序技术,从肺腺癌患者手术标本(癌与癌旁配对组织)中获取差异表达的circRNA,结合已有生物信息学数据库,鉴定筛选出一个在肺腺癌组织中显著高表达的circRNA即circ_0007766。随后,在肺腺癌组织样本中验证了circ_0007766与肺腺癌患者临床病理特征及预后的相关性。进一步,通过体外实验对circ_0007766的生物学功能进行验证。最终,对circ_0007766促进肺腺癌增殖的相关机制进行初步探索。
结果:通过高通量芯片筛查差异表达cirRNA,对芯片结果进行KEGG及GO分析后发现共有194条circRNA与肺腺癌恶性特性相关,进一步与数据库进行比对,共筛出5条差异表达circRNA。结合肺腺癌患者临床病理特征及预后资料,发现circ_0007766表达的均一性最好,且其表达量与肺腺癌分期及预后呈正相关,即circ_0007766表达越高,肺腺癌分期越高,患者预后越差。随后,我们设计了circ_0007766的特异性siRNA,体外细胞功能学实验结果表明干扰circ_0007766可以显著抑制肺腺癌细胞的增殖。通过生物信息学方法预测结合RIP实验验证,发现circ_0007766可与eIF4A3蛋白结合,eIF4A3蛋白作为eIF4A(eukaryotictranslationinitiationfactor4F,真核翻译起始因子4F)家族成员之一,可与靶mRNA结合,并通过无义介导的mRNA降解途径(nonsense-mediatedmRNA decay,NMD)在转录后水平调控细胞周期关键蛋白CyclinD1/CyclinE1/CDK4的表达,进而调控肺腺癌细胞的增殖。
结论:本研究通过高通量芯片筛查并结合数据库和临床样本资料验证,鉴定出一条与肺腺癌临床及预后呈正相关的环状RNA分子即circ_0007766。体外功能学研究表明circ_0007766可促进肺腺癌细胞增殖,进一步的分子机制研究发现circ_0007766可通过招募eIF4A3蛋白,从而上调细胞周期关键蛋白CyclinD1/CyclinE1/CDK4的表达,进而促进肺腺癌恶性增殖。本研究以circRNA为视角,将对肺腺癌发生发展机理及预后判断提供新线索,为临床治疗应用提供新靶标。