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建立和健全社会保障体系是建设社会主义和谐社会的重要任务。每个人都会发生疾病风险，通过医疗保障来分散疾病风险非常必要，但由于逆向选择和道德风险的双重作用，医疗保障成为社会保障体系中覆盖面最广、运行最为复杂的一项重要内容。尤其在我国农村，由于人口众多、地域分散以及城乡二元结构的存在，农村医疗保障具有明显的主体多元性、广覆盖性、复杂性、精算困难等社会特性。建立可持续发展的农村医疗保障制度，不仅是农民健康的需要，也是统筹城乡事业、构建和谐社会、促进经济发展的需要。
传统的合作医疗曾经较好地解决了我国农村居民的医疗问题，但随着农村经济体制改革的深化，传统合作医疗逐渐衰退，农民医疗卫生状况急剧恶化，看病难问题日益突出。为了解决农村居民的看病就医问题，帮助农民抵御重大疾病风险，提高农民的医疗保障水平，推进农村卫生事业改革与发展，实现“人人享有卫生保健”的目标，我国政府从2003年起开始进行试点，并在全国范围内逐步建立起新型的农村合作医疗制度。本文通过对江苏省新型农村合作医疗运行状况及存在问题进行分析，提出有利于新型农村合作医疗长效运行的思路和对策。
全文共分八个部分。
导论部分，主要说明研究背景、研究目的和意义、研究思路和方法、优点与不足。
第一章为理论研究，主要阐述医疗保障相关理论及对建立我国农村医疗保障的影响。
第二章为国际医疗保障实践及对我国的启示。主要通过阐述国家医疗保障、社会医疗保障、商业医疗保障、储蓄医疗保障四种模式的特征和优缺点和介绍国际农村医疗保障实践经验，谈谈对我国的启示。
第三章为历史回顾，主要阐述了农村医疗保障制度在我国的发展历程以及新型农村合作医疗制度的建立及其重要意义。
第四章为介绍江苏省近年来新型农村合作医疗运行情况，主要阐述取得的成效及经验。
第五章为剖析新型农村合作医疗运行过程中存在的问题，重点阐述基金筹集、服务提供、基金使用等方面存在的不足及形成原因。
第六章为针对影响新型农村合作医疗长效运行的因素，提出可持续发展的思路和对策，重点从建立科学合理的筹资机制、建立合理的费用补偿和费用控制机制、强化基金监督管理、建立有利于新型农村合作医疗持续发展的外部环境等方面寻找解决问题的对策。
结论部分，主要是总结研究成果，并指出研究的局限性。
本文采用理论与实践相结合、规范分析与实证分析相结合的方法，系统分析建立新型农村合作医疗制度的必要性；全面分析江苏省新型农村合作医疗制度所存在的问题，并从四个方面提出使新型农村合作医疗平稳、有序运行，发挥更好更高的效率的具体思路和对策。一是要建立强制的、与经济发展水平相适应、政府大力支持的、筹资方式有效便捷的合理的筹资机制；二是要控制医疗费用不合理增长，建立补偿模式、补偿比例合理的费用补偿与费用控制机制；三是要规范制度建设、防范基金运行风险、加强基金管理；四是要从提高农村医疗卫生服务能力、完善农村医疗救助制度、深化药品流通体制改革、创造良好的舆论氛围、加强农村基本公共卫生服务等方面，为新型农村合作医疗可持续发展提供健康的外部环境。