拟南芥(Arabidopsis thaliana)DC1蛋白在根伸长发育及盐胁迫应答中的功能研究

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根是植物从土壤中吸收水分和营养物质的重要器官,根系的发育情况直接决定植株的生长发育状态。DC1蛋白是一类富含半胱氨酸和组氨酸的锌指蛋白,是一类分布广泛、功能多样的蛋白,主要参与植物盐、干旱、光、氧化等多种非生物胁迫的应答反应,也参与调控植物多个时期的生长发育。拟南芥DC1蛋白家族拥有近150个成员,但其功能及作用机制目前尚不清楚,为揭示这一类蛋白在根发育中的功能,我们从该家族中遴选了一个在根中优势表达的DC1基因,命名为AtDC1-1。AtDC1-1在根分生区和伸长区间的过渡区优势表达,可能参与调控根分生区和根伸长区细胞的分裂和分化。本文主要研究AtDC1-1基因在拟南芥初生根发育中的功能及其调控网络,结果如下:1、AtDC1-1启动子活性分析为了分析AtDC1-1启动子活性,克隆了AtDC1-1基因长度为4034bp的启动子序列并构建pG2NBL-AtDC1-1p::ERYFP启动子活性检测表达载体,转化拟南芥,逐代筛选得到转基因拟南芥纯合体。在共聚焦显微镜下观察经PI染色垂直培养5 DPG拟南芥根长发现,该启动子在根分生区向伸长区过渡区域的表皮细胞和皮层细胞中活性很高,在根冠细胞中亦有较高活性。2、dc1-1突变体表型分析对AtDC1-1基因的3个T-DNA插入纯合突变体(dc1-1a、dc1-1b、dc1-1c)的表型观察发现,与野生型相比,这些突变体都不同程度地表现出短根,根发育滞后的表型,其中dc1-1b突变体表型最为突出,5 DPG的dc1-1b的主根长度仅为野生型的2/3。进一步观察发现,突变体根分生区长度较野生型短,细胞数量显著少于野生型。突变体根伸长区亦变短,但伸长区细胞数量与野生型没有明显差异,主要由细胞长度变短引起。上述结果表明AtDC1-1基因的敲除可能导致细胞分化速度大于细胞分裂速度,使植株主根发育滞后。3、AtDC1-1过量表达转基因拟南芥表型分析我们构建了 pK7CWG2-AtDC1-1过量表达载体并转化拟南芥,获得了多个AtDC1-1过量表达转基因拟南芥株系。与野生型相比,AtDC1-1过量表达转基因植株生长较快,主根长度明显高于野生型。其分生区长度明显增加,细胞数目显著增多,但其伸长区长度略短于野生型,细胞长度也较野生型短,表明AtDC1-1基因过量表达能促进细胞分裂。4、RNA-Seq分析dc1-1b突变体5 DPG根中差异表达基因为揭示AtDC1-1参与根发育的作用机制,我们利用RNA-Seq技术分析了野生型与dc1-1b突变体5 DPG根中差异表达基因。转录组测序结果显示,在dc1-1b突变体中有23个基因表达明显上调,61个基因表达明显下调。在表达上调的基因中,有两个与细胞分裂素降解代谢有关的基因,CKX3和UGT85A1,其转录本明显高于野生型。此外,CRF4、CRF3及ARR3三个负调控细胞分裂素(CK)反应的基因的表达量也明显增加。由此推测,AtDC1-1蛋白的缺失可能导致CK降解,根尖CK水平下降;同时,AtDC1-1蛋白的缺失还可能抑制下游的CK反应,两方面的影响使植株根发育出现CK缺乏的表型,即细胞分裂、分化失衡,根发育受阻。5、AtDC1-1上游调控因子及其互作蛋白的筛选鉴定为了分析AtDC1-1参与拟南芥根发育的基因调控网络,我们利用酵母单杂交和酵母双杂交技术筛选拟南芥转录因子文库,分离获得了三个能与AtDC1-1启动子结合的转录因子,分别是CBF4、CBF1、AtHB31。同时,还筛选鉴定了四个与AtDC1-1的互作蛋白,分别是 IAA27、SINAT4、ZML2、MYB-L,其中,ZML2(ZIM-like 2)属于GATA Ⅲ亚家族,与锌指蛋白家族结构类似,已有研究报导ZML2参与根发育调控,推测ZML2可能与AtDC1-1共同发挥作用影响植物的生长发育。6、AtDC1-1参与拟南芥盐胁迫应答功能研究为研究AtDC1-1是否参与拟南芥非生物胁迫应答,我们对dc1-1突变体和过量表达转基因植株进行ABA、高盐及甘露醇等胁迫处理。结果显示,dc1-1b突变体对高盐处理比较敏感,而过量表达转基因植株对盐不敏感,具有较强的盐耐受性。表明AtDCl-1参与植株盐胁迫应答。转录组数据亦显示很多已知的盐胁迫应答基因如AZF2、Z4T10等基因在dc1-1b突变体中表达量较低。qRT-PCR结果显示在盐处理条件下,过量表达植株中AZF2、ZAT10等基因显著上调,上升的幅度明显高于野生型,而在突变体中这些基因的表达亦略上调,但明显低于野生型。以上结果表明AtDC1-1参与了拟南芥盐胁迫应答,过量表达该基因能增强植株对盐的耐受性。
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