【摘 要】
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芹菜夜蛾是一种重要农业害虫,危害多种重要粮食作物和蔬菜。芹菜夜蛾核多角体病毒（Anagrapha falcifera nucleopolyhedrovirus,AnfaNPV）是芹菜夜蛾的病原体和天然生态控制因子。前期对AnfaNPV部分基因序列的分析结果显示,AnfaNPV与α-杆状病毒属Ⅰ组的薄荷灰夜蛾核型多角体病毒（Rachiplusia ou multiple nucleo-polyhed
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芹菜夜蛾是一种重要农业害虫,危害多种重要粮食作物和蔬菜。芹菜夜蛾核多角体病毒（Anagrapha falcifera nucleopolyhedrovirus,AnfaNPV）是芹菜夜蛾的病原体和天然生态控制因子。前期对AnfaNPV部分基因序列的分析结果显示,AnfaNPV与α-杆状病毒属Ⅰ组的薄荷灰夜蛾核型多角体病毒（Rachiplusia ou multiple nucleo-polyhedrovirus,RaouNPV）、苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒（Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus,AcMNPV）和小菜蛾核多角体病毒（Plutella xylostella multiple nucleopolyhedrovirus,Plxy MNP V）近缘。本文完成了对 AnfaNPV 全基因组测序和序列分析,为解析该病毒的遗传学特征和开发利用积累基础资料。利用差速离心从AnfaNPV感染致死的甜菜夜蛾幼虫腐烂组织提取病毒包涵体,依次通过碱裂解、蛋白酶K处理、酚-氯仿抽提和乙醇沉淀从病毒包涵体纯化DNA。参照RaouNPV基因组序列合成108对PCR引物,以纯化的AnfaNPV DNA为模板扩增出平均长度为1900 bp左右的DNA片段,利用ABI系统完成测序;利用Geneious Prime 2019.1软件将所获得的187个长度为200-900 nt的读序拼接、组装成完整的基因组序列。组装完成的AnfaNPV完整基因组由133258 bp组成;G+C含量为39.96%;包含150个由至少50个密码子组成、互不重叠的开放阅读框（open reading frame,ORF）;包含9个由数目不同的长度为30 bp的不完全回文序列组成的同源重复区（homologous repeats region hr）。AnfaNPV基因组包含的ORF中包括38个杆状病毒核心基因。其ORF都具有其它杆状病毒的对应同源基因,不存在其特有的ORF;但af95同源ORF仅有ac97。基因极性图显示AnfaNPV基因组与RaouMNPV、AcMNPV和PlxyMNPV基因组完全共线性。AnfaNPV基因组比RaouMNPV多1732bp,比AcMNPV和PlxyMNPV 分别少 636bp 和 1159bp。AnfaNPV 基因组与 RaouMNPV、AcMNPV 和PlxyMNPV基因组的序列相同度分别为97.34%、97.05%和96.32%。145个ORFs为这四种杆状病毒共有的ORFs。AnfaNPV与RaouMNPV、AcMNPV和PlxyMNPV编码序列完全一致的ORF数分别为46、42和23个。基于34个杆状病毒核心基因序列的系统树分析结果显示AnfaNPV归类于α-杆状病毒属Ⅰ组,与RaouMNPV最近,但属于不同的病毒种。
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