【摘 要】
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为了解渤海硝酸盐异化还原成铵细菌的结构与分布情况,以功能基因nrfA为分子标记构建渤海沉积物中DNRA细菌的基因文库结合渤海沉积物中间隙水的环境因子来研究。渤海6个站位总
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为了解渤海硝酸盐异化还原成铵细菌的结构与分布情况,以功能基因nrfA为分子标记构建渤海沉积物中DNRA细菌的基因文库结合渤海沉积物中间隙水的环境因子来研究。渤海6个站位总共筛选了505个nrfA基因的有效克隆,每个站位根据DNA酶切带型划分的OTUs的个数也在40-55之间,最相似序列的相似度在68％～100％之间,显示了较高的物种多样性,使用软件DOTUR分析后共得到78个OTUs(AA5％cutoff)。利用NCBI数据库中21个最相似的氨基酸序列作为参考序列后,用PHYLP(version3.69)软件包构建系统进化树,包括荷兰,英国河流的含水层和沿海沉积物的nrfA序列;将其划分为四个簇。对渤海各站位进行UniFrac聚类分析,包括Cluster Environments、Jackknife Cluster和PCoA聚类分析,结果表明B11、B7、B15站位聚在一起,再与B5相聚,B1和B3站位相聚在一起,与其它站位关系较远。渤海各站位环境因子的聚类分析结果表明DNRA细菌的菌落结构和分布是由于沉积物间隙水中溶解性无机氮、溶解氧、pH等多种环境因子共同作用的结果。
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