肺癌特异性DKK 1基因转录调控元件的分析预测及活性筛选

• 作 者: 李文茂 高燕 许瑞安
• 机 构: 华侨大学分子药物教育部工程研究中心厦门361021;华侨大学生物医学学院/分子药物学研究院泉州362021华侨大学分子药物教育部工程研究中心厦门361021;华侨大学生物医学学院/分子药物学研究院泉州
• 出 处: 华东六省一市生物化学与分子生物学会2015年学术交流会
• 发表日期: 2015年12期
• 关键词: 肺癌 DKK1基因 转录调控因子 活性筛选

Dickkopf1(DKK1)是经典wnt信号通路的拮抗剂,它可以与Lrp5/6受体蛋白结合,对wnt信号通路产生竞争性抑制作用.此外,DKK1在多种非小细胞细胞系、组织中均具有特异性、高水平表达的特点,可作为一种肺癌诊断的血清标志物.我们之前的研究发现DKK1启动子在肺癌中的活性并不是很高,因此我们认为仍可能存在其他转录调控元件(Transcriptional regulatory elements,TREs)增强子协同调控启动子活性.鉴于目前涉及DKK1增强子等调控元件的研究较少,主要集中在DKK1启动子片段上,筛选鉴定DKK1增强子片段可用于进一步的DKK1调控机制研究.参与基因转录调控的这些转录调控元件主要包括启动子、增强子、绝缘子等，与启动子元件一般位于调控基因的5’端不同，增强子等调控元件在散布在基因组中，位置并不固定。本研究的关键难点在于对DKK1基因增强子等转录调控元件在基因组中预测及定位。研究通过UCSC人类基因组浏览器获取A549细胞中DKKI基因位点的DNase1超敏性、组蛋白修饰等表观遗传信息，对这些信息进行分析，得到12条候选增强子元件序列，用于下一步高活性增强子片段筛选。
鉴于DKK1启动子全长片段较大，因此需要筛选一段具有较高活性且片段较小的近端启动子片段。首先本文先将四段不同长度的DKK1启动子片段构建到pGL3-basic载体中，选择其中一段作为DKK1基因近端启动子片段。将构建得到的重组载体转染A549,H460,H446,Eca-109,Chang liver和HEK293细胞，并通过双荧光素酶报告基因系统检测不同长度DKK1启动子片段活性，最终我们确定DKK1-5片段活性较好，可作为DKK 1基因近端启动子片段。
最后我们将这12条候选片段分别插入到DKK1-5近端启动子上游，成功构建重组质粒，并通过双荧光素酶报告基因检测系统检验相关候选元件的增强子活性。本文在细胞水平得到六段候选元件:在A549细胞中TRE3、TRE4、TRE6、TRE7、TREB、TRE12对DKK1启动子具有显著增强作用。TRE3、TR4、TRE12在H460中具有显著增强作用。而且TRE3、TRE4、TRE7、TRE8对DKK1启动子的增强作用具有非小细胞肺癌特异性。