碳重离子照射胚胎成纤维细胞的蛋白表达谱分析与验证

来源 :中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:linba
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  [目的]利用生物"组学"和生物信息学技术手段,研究重离子辐射致细胞损伤与应答调控的蛋白表达谱,建立辐射损伤反应的定量描述数据库. [材料与方法]采用正常鼠胚胎成纤维细胞(MEF),给予碳离子照射,分组如下:对照组、0.5Gy坪区照射组、2Gy坪区照射组、2Gy峰区照射组.坪区:LET∶12.6keV/um,300MeV/n;峰区:LET∶ 25.4 keV/um,100 MeV/n.照射后4h收集细胞,提取MEF细胞总蛋白,iTRAQ多重化学标记LC-MS质谱分析;免疫印迹杂交(Western blot)验证蛋白表达.[结果](1)不同的数据库(GO分析,KEGG分析,MIPS分析,BIOCARTA分析,PID分析,REACTOME分析)分析显示碳离子辐照后差异较显著的蛋白与以下几种通路有关:蛋白酶体通路;mRNA加工;DNA损伤;mRNA拼接和细胞分裂.基于文献和网络分析,确定了一些来自蛋白酶体、细胞周期、DNA损伤、泛素连接酶结合途径、RNA剪接、RNA代谢中的蛋白质形成相互紧密联系的网络,并且受碳离子辐照的影响而导致广泛集中.(2)网络分析差异表达的蛋白结果显示:细胞对低剂量辐照网络分析较复杂,随着辐照剂量的增加,基因的表达显著降低,网络分析图也相对简单,由此推断,高剂量的2Gy坪区和2Gy峰区已经超过细胞耐受阈值,可能产生更多潜在的致死性双链断裂,损伤不可逆转.而低剂量(0.5 Gy)辐射诱发的一些基因表达调控网络的变化,对辐照反应可能有保护作用.(3)碳离子辐照4h后,γ-H2AX蛋白表达随剂量增加表达增加的趋势,与数据库分析方法检测的相一致.[结论]通过碳离子辐照正常鼠胚胎成纤维细胞,分析其蛋白表达谱,建立了空间辐射的生物损伤反应的定量描述数据库.
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