DNA存储信息:突破极限

来源 :科技生活 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengyufengsc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  DNA是个生物数据库,存储着我们体内的海量基因代码。科学家发现,它的这种能力其实还可以用来存储外部信息,一克DNA即能储存上千亿个千兆字节,相当于1000亿张DVD光盘的内容。
  近日,哈佛大学维斯生物工程研究所的研究人员将一本大约有5.34万个单词的书籍编码到不到一沙克(亿万分之一克)的DNA(脱氧核糖核酸)微芯片中,连同文字一起的还有11张图片和一段Java程序。这是迄今为止人类使用DNA遗传物质储存数据量最大的一次实验,被刊登在最新《科学》期刊上。团队负责人乔治·丘齐(George Church)表示,“今后,拇指大小的设备或许就能存下整个互联网的信息。”
  DNA存储的“野心”
  “利用DNA来存储数据并不是一个新的概念。事实上,自从生物学确定了DNA结构,就有研究人员尝试将其用于存储和运算”,北京华大基因研究中心医学事业部主任甄二真告诉记者。
  他介绍,DNA由4种碱基组成,分别为A(腺嘌呤)、 C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤)及 T(胸腺嘧啶),它们两两互补成对出现,共同构成了相互缠绕的双链螺旋结构。DNA可以被视为四位运算存储方式,存储量比二位运算存储大得多。
  “目前通用的存储模式都是二位运算的。为了存储更多数据,早已有科学家尝试过使用物理方法实现四位运算。但是技术上难以实现,只能出现‘有’、‘无’、‘中间’三种状态,也就是三位运算,无法实际操作”,甄二真说,与之相比,DNA是天然的四位运算,有四个不同状态,与二位运算相比存储量大、运算速度也快得多。
  处于信息爆炸的时代,很多科学家尝试以DNA存储数据。比如今年初,台湾国立清华大学和德国卡尔斯鲁厄技术研究所以三文鱼的DNA作为基础,制造出单次写入多次读取的存储器。不过,这个DNA存储器的有效时长只有30小时。
  甄二真表示,这些DNA无法长期存储数据是因为研究人员使用的是来自活细胞的基因组,这些细胞不仅会死亡,而且还会分裂复制,对其中存储的数据有致命性打击。
  合成DNA:改变存储模式
  为了排除细胞会死亡、分裂、变异而使数据内容发生改变的危险,丘奇率领的团队避免使用活细胞,而是采用人工合成的DNA片段,并将片段用喷墨打印机嵌入到芯片上。
  这一次,丘奇选择存储在合成DNA片段上的信息是他的著作《再生:合成生物学将如何改变未来的自然和自己》。首先,他把书中的图片、文字、程序转化为HTML格式的文件,再将其编译为由 0和1组成的电脑能够读懂的二进制数据。随后,这些二进制数据被转化为四种碱基,即把0转为A或 C,把1转成G或者T,并将其建立在DNA双链螺旋结构上来。
  至于读取数据的过程其实就是测序,通过DNA测序仪将DNA序列中的编码按顺序排列,还原为二进制格式的数据,用电脑“读”出来。
  尽管听起来很复杂,甄二真表示其中重要一步就是将二进制数据转化为4位运算数据(A、C、G、T),做成DNA链结构,这可以使存储量按级数增长。而以经化学反应得到的合成DNA取代活细胞使得这项研究成果更符合现实意义。此前以细胞内DNA来存储信息一直无法取得技术突破,只能在短期内保证数据安全,此次转换思路是被《科学》认可的关键。
  突破传统存储的极限
  与目前流行的存储方式相比,DNA存储的最大优势就是单位存储量大。北京邮电大学信息与通信工程学院副教授陈光表示,现在使用的光介质和磁介质在存储量上都几乎达到了极限,这就需要研究其他存储方式,比如DNA存储这样的生物介质。
  他告诉记者,磁介质包括磁带、磁盘、硬盘等。硬盘的存储量可达上百G,但由于现在硬盘数据存储密度提升的空间已经有限,基本不太可能出现单碟1000G的硬盘,所以如果硬盘体积不变,容量难以实现大幅突破。而CD、DVD等光介质存储对表面积的要求更大,磁介质可以分几层存储数据,光介质只能单层平铺保存信息,单位存储量更小。
  DNA可以很好地解决这一存储量的问题。甄二真表示,这不仅与四位运算的特性有关,也与DNA特有的双链螺旋结构有关。这一结构可以把DNA序列压缩得足够小,整个立体空间都可以利用,比磁介质和光介质的平面存储更具优势。按照哈佛团队给出的数据,“一克DNA即能储存上千亿个千兆字节,相当于1000亿张DVD光盘的内容”。
  此外,合成DNA的稳定性也很优秀。陈光介绍,磁介质是建立在电磁的基础上,工作环境受到限制,容易出现消磁等现象;而光介质受环境影响小一些,但耐久性不理想。与这两者相比,合成DNA不存在细胞死亡、变异等影响,在室温下很稳定,甚至可以存放数万年而不变。
  尚难大范围应用
  对于DNA存储的前景,此项目另一位负责人瑟里拉姆·库苏里(Sriram Kosuri) 表示,随着DNA合成、测序价格的不断下降,这或许将成为长期存储数据的一种选择。而现阶段,它距离商业化还很远。
  甄二真表示,不仅是成本问题,DNA存储还存在控制难点。与二进制存储相比较,磁介质0、1之间的转换只需加磁、消磁即可实现,而光介质可以通过刻录机将数据以“平地”或“坑洼”的形式烧写在光盘上,这些都比较容易实现。而将数据“写”入DNA则困难得多,难以做到“即时写”,因此目前只有数据归档等用途。
  同样的,合成DNA相当费时。甄二真介绍,目前已经有自动合成仪可以将碱基连接起来,形成DNA序列,但是一般只能连接20到30对碱基,再长就难以实现了。此次哈佛团队采用的也是短DNA序列来编码数据。
  与写入数据费时费力相比,利用测序仪来读取DNA存储数据虽然速度也不快,但是甄二真认为,未来测序速度大幅提高相对容易实现,也就是DNA存储有可能做到“即时读”。
  在陈光看来,有些应用对写入数据的速度要求不高,只要读取速度可以接受就行了。此外,作为生物介质之一,DNA存储于人体更具“亲和力”,较易与人体蛋白融合。未来有一天也许可以嵌入人体内工作,这时只需存入特定数据就可以了,存储慢的问题就很好解决了。
其他文献
随着城市越来越大,交通越来越拥挤,以及能源消耗激增和医疗资源日益紧缺,城市、尤其一些大型城市,成为了人们爱恨交织的对象。面对这些“成长的烦恼”,9月上旬,“智慧城市发展高峰论坛”试图寻找答案——人类完全可以让城市智慧起来,利用信息化技术和管理,人类可以把城市“装扮”得更美好。  家里电表、燃气表余额不足时就能收到短信提醒;燃气泄漏,户主用手机遥控关闭阀门;网购后能‘追踪’快递员的具体位置,这不是科
期刊
目前,全球有不少于200个智慧城市项目正在实施中。2007年10月欧盟委员会发表的《欧洲智慧城市报告》显示,智慧城市可以从智慧经济、智慧流动、智慧环境、智慧公众、智慧居住和智慧管理六大维度来界定。事实上,这些智慧城市的“智慧点”各有不同。  哥本哈根:自行车之城  丹麦首都哥本哈根志在成为全球第一个二氧化碳零排放之都。目前看来还是很有希望的,它的绿色交通成绩突出。  数据显示,如果你驾车出行,二氧
期刊
精彩的科学魔术表演,绚丽的五彩烟花燃放。9月13日晚上,2012年北京科学嘉年华开幕式在奥利匹克公园上演,随后的四天时间里,成千上万的市民开了一场科学大PARTY,体验科学的魅力。  没有玩不到,只有想不到  2012年全国科普日的主题是“食品安全与公众健康”,作为北京主场的标志性活动,第二届北京科学嘉年华活动专门设置了“食品健康体验馆”,你可以品尝到有机农场出产的牛肉、鸡肉。一些老年人还可以在这
期刊
犯罪分子作案在逃,即使整容,在高科技面前也将无所遁形。  由于视频监控正在快速普及,在众多的视频监控技术当中,  人脸识别技术可以从监控视频图像中实时查找人脸,并与人脸数据库进行实时比对,  让警方快速抓捕逃犯。  今年8月以来,中国保钓事件继续发酵,北京、深圳、广州、成都、长春、西安等地,相继发生规模较大的反日示威游行,爱国热情举世睹目。但是令人遗憾的是,也有一些不法分子打着“拒绝日货”的旗号或
期刊
近日有8家企业违法给中药饮片染色达到增重目的已被责令停产,染色增重的中药材不仅影响疗效,还会减少药性,吃多更会对肝肾以及神经系统造成不可挽回的损伤。  近日,国家食品药品监督管理局网站上,曝光了一批生产企业违法给中药饮片染色达到增重目的。目前8家严重违规的企业被责令停产整顿,6家企业被收回药品GMP证书,并对12家企业立案调查。  中药饮片造假成行业“潜规则”  国家食品药品监督管理局通报中称,在
期刊
比起前代产品,北京时间9月13日iPhone 5登场,让人亢奋不起来。它的确有着更轻更薄的机身、更炫的屏幕、更快的速度和更新的网络支持,但依旧不太让果粉感冒。  一方面是因为iPhone 5发布前的各种爆料,太详尽太确凿了,没有任何的神秘感。这不同于前代任何产品的严格保密,即使当年的样品机丢失,也没有iPhone 5曝光得这么一丝不挂。或许是苹果公司的故意为之,抑或是当前的通联水平,让保密工作越来
期刊
中信地产的“中国尊”已经破土动工。2016年,它将以528米的高度成为新的地标式建筑。摩天大楼的建设一定要满足以人为本的理念,不能背离这个初衷。  摩天大楼的建设热情在中国一直没有熄灭。  摩天大楼愈演愈烈  “重庆国际金融中心”的规划高470米;2009年开工的深圳“平安国际金融大厦”算上塔顶共有660米高;2008年底开工的上海中心大厦总高为632米;计划中的长沙“远望大厦”将高达838米,其
期刊
建设智慧城市是一项庞大的、复杂的系统工程,面对这样的局面,我们最需要的准备是什么?是技术吗?是资金吗?是人才吗?毫无疑问,这些都是必不可少的、非常重要的前提和条件。但是我在这里想要强调的是,我们最需要准备的是组织和规划的新的政策思路和实施机制。如果缺乏了这方面的准备,技术、资金、人才的作用都将会大打折扣,甚至走到事与愿违、偏离初衷的歧路上去。  这是不是有点危言耸听?今年的北京“7·21”大暴雨就
期刊
上班时侃侃而谈,回到家却疲惫懒言;应酬时笑容满面,面对亲友时却麻木冷淡,这是下班沉默症的症状。长此以往可能影响家庭氛围,甚至导致抑郁。试着把心打开,世界没那么糟。  近日,包括中国青年报在内的三家媒体,对2750人进行的一项调查显示,83.1%的受访者坦言自己不同程度上有下班沉默症。其中,34.7%的人认为自己有下班沉默症,48.4%的人认为自己“有一些”。下班沉默症已经成为一个无法忽视的心理问题
期刊
9月8日,第十四届中国科协年会在石家庄隆重开幕。作为这次年会的专项活动之一,中国科协主席韩启德专程来到河北医科大学,与河北大学生见面,和同学们自由地交谈。  ○大学生:我是河北医科大学中西医临床专业学生,入学时大家都觉得我们专业很有发展,但这几年下来给我最深刻的感受是中西医在现阶段似乎无法结合。而且面对就业压力,大家纷纷选择转专业甚至有人选择转行,您觉得如何能做到真正地中西医结合呢?  ●韩启德:
期刊