基因芯片靶向预测牙周膜干细胞骨向分化中特异性circ-RNA与mi-RNA联接的研究

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背景:  牙周炎是世界上最广泛流行的感染性疾病之一,是中老年人牙齿缺失的主要原因,严重威胁着人类全身健康.传统洁治、刮治、根面平整等基础治疗,只能消除病因,无法完全修复已丧失的牙周组织.牙周组织再生是治疗牙周病的有效途径,以干细胞为基础的疾病治疗一直是生物医学研究的重点内容.  牙周膜干细胞(Periodontal ligament stem cells,PDLSCs)是牙周组织重建的种子细胞,它是间充质干细胞的一种,具有自我更新和多向分化的能力,在特定培养条件下能分化为成纤维细胞,成牙骨质细胞、成骨细胞、脂肪细胞及神经细胞等.牙周组织再生的关键是它的骨向分化,但它的机制并不是很清楚,已知微小RNA(MicroRNA,miRNA)在其中具有重要的调控作用.  环形RNA(Circular RNA,circRNA)是一种特殊的非编码RNA分子,与线型RNA不同,它呈封闭环状结构,比线性RNA稳定,不易被核酸外切酶降解,尤其是近年来发现它具有miRNA海绵和调控转录的功能,是分子生物学领域的研究热点.由于circRNA具有重要的生物学功能,猜想它也可能通过与miRNA相互作用在PDLSCs的骨向分化过程中发挥着调控功能.  目的:  1.检测PDLSCs成骨前后整体circRNAs的差异性表达情况,并预测差异性表达circRNAs的miRNAs结合位点,为以后研究circRNAs在PDLSCs骨向分化中所起的作用提供了一个有用的数据库.  2.探讨PDLSCs骨向分化过程中特异性circRNA与miRNA联接,为进一步研究circRNA在其中的机制提供线索.  方法:  1.体外分离、培养和鉴定PDLSCs.  2.对PDLSCs进行骨向诱导,circRNA芯片检测PDLSCs成骨前后circRNAs的差异表达.  3.TargetScan和miRanda软件预测差异表达circRNAs的miRNAs结合位点,按mirSVR值取前5名,由低到高排列.  4.靶向预测PDLSCs骨向分化过程中特异的circRNA与miRNA联接.  结果:  1.免疫磁珠法分选出PDLSCs,并且用免疫细胞化学进行鉴定,发现其表面表达STRO-1和CD146,胞浆波形蛋白(Vimentin)抗体染色阳性,角蛋白(Cytokeratin)抗体染色阴性.  2.PDLSCs骨向诱导21d后,circRNA芯片检测到差异性表达的circRNAs有177个,其中61个表达上调,116个表达下调.  3.建立了Top5circRNA-miRNA联接.  4.Hsa_circ_0008085在PDLSC骨向诱导21d后高表达,倍数为4.13±1.07.  结论:  用基因芯片获得了PDLSCs骨向分化前后177个差异表达的circRNAs,通过TargetScan和miRanda建立了Top5circRNA-miRNA联接,为以后研究circRNA在PDLSC骨向分化中的作用提供了一个有用的数据库.靶向预测到hsa_circ_0008085可能通过与miRNA-146a相互作用在PDLSC骨向分化中发挥着调控功能,为进一步研究circRNA在其中的机制提供了线索.
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