BCO2、GNAS基因与朝鲜鹌鹑羽色性状的相关性研究

来源 :河南科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:freedomo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鹌鹑羽色丰富,其突变性状明显且易于观察,是研究鸟类羽色变异和开展遗传学实验的好材料。目前鹌鹑作为实验动物已广泛应用于生态学、畜牧学和生物医学等领域的研究。本试验以栗羽和白羽朝鲜鹌鹑为研究对象,对BCO2基因和GNAS基因进行一系列研究,来探究这两个基因在鹌鹑体内的表达量高低、CDS区生物信息学分析以及某一突变位点与鹌鹑不同羽色的表型性状的关联性。具体研究结果如下:
  1.BCO2基因在朝鲜鹌鹑胚胎发育至6~8d时的表达水平高于发育到10~14d,发育到10d时表达量最小;BCO2基因在白羽鹌鹑胚胎组织中的表达水平整体高于栗羽朝鲜鹌鹑,其中胚胎发育到10~14d时,该基因在白羽鹌鹑胚胎组织中的表达水平极显著(P<0.01)高于栗羽鹌鹑。GNAS基因在朝鲜鹌鹑胚胎发育至6d时的表达水平低于发育到8~14d,当发育至8d时,表达量达到最大;GNAS基因在栗羽鹌鹑胚胎组织中的表达水平整体高于白羽朝鲜鹌鹑,其中胚胎发育到8~14d时,GNAS基因在栗羽鹌鹑胚胎组织中的表达水平高于白羽鹌鹑且差异极显著(P<0.01)。
  2.BCO2基因位于鹌鹑第24号染色体上,CDS区开放阅读框(ORF)长度是1470bp,含有15个外显子,编码的蛋白含490个氨基酸,等电点是4.99,分子质量为121283.77Da,计算得出的不稳定性指数(Ⅱ)为48.25,GRAVY值为0.763,该蛋白被认定为不稳定的疏水性蛋白。BCO2氨基酸序列与日本鹌鹑和原鸡等禽类动物的BCO2氨基酸序列有很高的同源性,与牛和羊等哺乳动物同源性较低,说明在物种进化过程中高度保守。GNAS基因位于鹌鹑的第20号染色体上,该基因的CDS区开放阅读框长度是1140bp,含有14个外显子,编码的蛋白含379个氨基酸,等电点为6.43,分子质量为44399.47Da,带正电荷氨基酸残基数为54,带负电荷氨基酸残基数为56,GRAVY值为-0.593,该蛋白被认定为稳定亲水性蛋白。GNAS氨基酸序列与禽类动物氨基酸序列有很高的同源性,与哺乳动物同源性相对较低,在物种进化过程中,该基因具有高度的保守性。
  3.在朝鲜鹌鹑BCO2基因上发现2个突变位点,其中g.14467C>A的优势等位基因为B,g.20132C>T突变位点的优势等位基因是A;多态信息含量均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5);朝鲜鹌鹑BCO2基因的2个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。对BCO2基因与朝鲜鹌鹑的羽色性状进行关联分析,BCO2基因在g.14467C>A突变位点上,栗羽朝鲜鹌鹑的3种基因型的频率分布与白羽朝鲜鹌鹑差异极显著(P<0.01),等位基因A能显著增强对胡萝卜素的分解,快速降解色素沉积,其中AA基因型个体>AB基因型个体>BB基因型个体。BCO2基因外显子7处的g.14467C>A突变位点与朝鲜鹌鹑羽色性状具有一定的关联性。在朝鲜鹌鹑GNAS基因上发现2个突变位点,其中GNAS基因的g.119221T>A在群体中的优势等位基因为B,g.121181A>G突变位点的优势等位基因是A;GNAS基因的2个突变位点均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5);2个突变位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。在g.121181A>G突变位点,栗羽朝鲜鹌鹑的3种基因型的频率分布与白羽朝鲜鹌鹑差异极显著(P<0.01),等位基因A能显著提高羽色沉积度,其中AA基因型个体>AB基因型个体>BB基因型个体。GNAS基因3′UTR处的g.121181A>G突变位点与朝鲜鹌鹑羽色性状具有一定的关联性。
  总结可知,朝鲜鹌鹑BCO2基因和GNAS基因的表达量高低和鹌鹑的羽色密切相关;朝鲜鹌鹑BCO2和GNAS基因序列分别与日本鹌鹑以及原鸡等禽类的BCO2和GNAS的基因序列同源性很高且高度保守;BCO2和GNAS基因的某一位点的突变与鹌鹑的羽色表型具有一定关联性。由此可以看出BCO2和GNAS基因是调控鹌鹑羽色性状的两个重要基因。
其他文献
辣椒作为重要的经济作物,在蔬菜生产中占据重要地位,但辣椒在种植过程中容易遭受病虫害的威胁,三唑类杀菌剂苯醚甲环唑是防治辣椒炭疽病等真菌性病害的主要农药品种之一,应用广泛且用量较大,然而我国的农药利用率普遍较低。因此,辣椒种植体系中苯醚甲环唑沉积规律、消解特征及其施药限量研究对提高农药利用率、降低农药使用量具有重要科学与现实意义。本文以典型杀菌剂苯醚甲环唑为目标农药,以露地辣椒-土壤生态系统为研究对
学位
R基因中最大的类型为NBS-LRR,根据NBS-LRR基因保守区域设计引物,从多种植物中克隆到许多结构上与抗病基因类似的序列(RGAs)。稻瘟病是水稻的重要病害,已从水稻中克隆并验证了3个抗稻瘟病基因的功能,它们都属于NBS-LRR类抗病基因。本文用简并引物从广东普通野生稻中克隆出多条RGA并测定其序列,并对序列进行了分析。用RT-PCR从培矮64中扩增出抗稻瘟病基因Pi-k全长cDNA。1.根据
学位
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus, PRRSV)引起的一种仔猪呼吸道障碍和母猪繁殖障碍的免疫抑制性传染病。本课题组前期研究发现,在进行人工感染PRRSV时,通城猪与大白猪相比具有较
学位
羊传染性口疮(Orf)是由副痘病毒引起的在山羊和绵羊群体中具有高传染性的人畜共患病。尽管目前有减毒和灭活的orf病毒(ORFV)疫苗,但它们既不能引起持久免疫,也不能避免再次感染。KISSI基因编码的吻素(Kisspeptin)通过与GPR54受体结合调控下丘脑-垂体-性腺轴(hypothalamic-pituitary-gonadalaxis,HPG轴),尽管kisspeptin作为促性腺激素释
鸡毒支原体(Mycoplasma gallisepticum, MG)主要引起鸡慢性呼吸道疾病(Chronic Respiratory Disease,CRD),感染率极高,且常与其他病原微生物继发或并发感染,给世界家禽业带来巨大的经济损失。MG感染宿主后与特异受体结合,通过宿主呼吸黏膜屏障进入血液循环,导致全身器官和组织感染,但其致病机制至今尚未阐明。研究证实外泌体可携带miRNAs随循环系统进
全基因组预测是一种利用覆盖全基因组标记预测未知表型的新兴技术,随着测序技术的不断更新和日趋成熟,基因分型成本越来越低,全基因组预测逐渐被推广应用于动植物选育以及人类疾病风险评分。统计方法在全基因组预测中起到至关重要的作用,直接影响表型的预测效果。基于亲缘关系的BLUP系列方法计算过程简单,具有较高的计算效率,但由于其模型假设粗糙,预测准确性往往不理想;基于标记效应的Bayes系列方法模型假设灵活,
骨骼肌是动物体内最丰富的组织,出生后肌肉的生长发育和再生过程主要依靠骨骼肌卫星细胞的增殖和分化。已有研究表明骨骼肌卫星细胞的增殖和分化过程受到多种与肌肉发育相关的信号通路、转录因子及表观修饰的调控,但是在不同猪种骨骼肌的发育过程中的调控作用和机制尚不清楚。我们选择在生长速度和肉质方面存在差异的约克夏猪和监利猪为研究对象,对两猪种骨骼肌卫星细胞增殖和分化6个阶段进行RNA-seq测序,以分析调控不同
学位

猪肉的生长速度和品质是猪遗传育种中重要的性状,这些性状主要取决于骨骼肌的生长发育过程。猪骨骼肌卫星细胞(porcine skeletal muscle satellite cells,PSCs)作为骨骼肌的干细胞,被激活后可以迅速增殖、分化、融合形成肌纤维,是研究骨骼肌生长发育的重要材料。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200nt的RNA,
学位

学位
学位