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目的:
通过分析肝癌患者和健康对照血清miRNA表达谱,寻找差异表达的miRNAs并通过qRT-PCR技术予以验证,探讨经验证差异表达的miRNAs在肝癌诊断中的临床应用价值。
方法:
1.选取69例均经临床和病理确诊且尚未接受手术、化疗、放疗等任何临床治疗肝癌患者作为研究对象,详细收集患者的临床及实验室检查资料,同时选取慢性活动性乙肝患者47例、健康体检者40例作为对照。确定研究对象后,采集研究对象静脉血3ml,分离血清保存待用。
2.在实验对象中选取3例肝癌患者血清和3例正常对照者血清,构建小RNA测序文库,基于illumina测序技术平台,进行单端测序,获得有差异表达的miRNAs,对差异表达miRNAs进行靶基因预测和候选靶基因的确定。
3.选取部分显著性差表达的miRNAs作为研究指标,采用qRT-PCR技术检测肝癌血清、慢性活动性乙肝血清和正常对照血清中miRNAs表达水平。根据qRT-PCR检测结果,初步确定肝癌患者血清差异表达miRNAs并作其与肝癌的logistic逐步回归分析,最后确定有效的差异表达miRNAs。分析最终入选的miRNAs与肝癌患者临床特征及实验室检测指标的相关性。
4.应用ROC曲线分析miRNAs对肝癌的诊断价值,包括灵敏度、特异性、准确度、阳性预测值、阴性预测值等,评价肝癌传统标志物AFP单独及与miRNAs联合检测在肝癌的诊断中的价值。
5.统计学处理:采用SPSS16.0统计软件,实验数据以(-x±s)表示,采用单因素方差分析肝癌组、慢性活动性肝炎组和正常对照组之间miRNA的差异表达,P<0.05有统计学意义。用logistic回归逐步分析有差异表达的miRNA(选入标准α=0.05,剔除标准α=0.10),筛选出有诊断价值的miRNA,求出Logistic回归方程。用Spearman相关分析miRNA与各临床特征指标的关系,P<0.05为差异具有统计学意义。使用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析单个指标和多指标联合检测对肝癌的诊断价值。
结果:
1.在肝癌血清和正常对照血清中筛选出42个差异性表达miRNAs,其中35个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。部分差异表达miRNAs可能与基因转录、细胞代谢、细胞周期以及细胞凋亡等相关基因的调空有关。
2.肝癌组和慢性活动性乙肝组血清中miR-320c、miR-4429、miR-4532较正常对照组血清相对表达量有上升趋势,且差异具有显著性差异(P<0.05);miR-1290在三组血清中的相对表达量无显著性差异;肝癌组血清中miR-769-5p、miR-223-3P较慢性活动性乙肝组和正常对照组血清相对表达量有下降趋势,且差异具有显著性差异(P<0.05);慢性活动性乙肝组血清中miR-744-5p的相对表达量与肝癌组和正常对照组血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05),肝癌组血清中miR-744-5P的相对表达量与正常对照血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05);慢性活动性乙肝组血清中miR-150-5p的相对表达量与肝癌组和正常对照血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05)。
3.根据以上统计结果,将miR-320c、miR-769-5p、miR-223-3p、miR-744-5p、miR-4429共5个差异表达miRNA入选为logistic回归分析,最后将miR-769-5p和miR-4429共2个差异表达miRNA入选,并做回归方程:P=1/[1+e-(0.687-4.919X1+2.151X2)](方程中的X1、X2分别代表miR-769-5p和miR-4429的相对表达量)。miR-769-5p和miR-4429与肝癌患者临床病理在指标均无显著性相关(P>0.05)。
4.miR-769-5p、miR-4429和AFP单项检测和联合检测在诊断肝癌中的ROC曲线分析:在单项检测中,miR-769-5p的AUC(曲线下面积)为0.803(95CI:0.691~0.914,P<0.001),灵敏度最高;AFP的AUC为0.798(95CI:0.707~0.889,P<0.001);miR-4429的AUC为0.877(95CI:0.811~0.943,P<0.001),特异性最好;在联合检测中,miR-769-5p联合miR-4429的AUC为0.874(95CI:0.806~0.942,P<0.001);miR-769-5p联合AFP的AUC为0.929(95CI:0.880~0.977,P<0.001);miR-4429联合AFP的AUC为0.934(95CI:0.888~0.981,P<0.001);三者联合检测的的AUC为0.956(95CI:0.917~0.995,P<0.001),灵敏度和准确度均最高
结论:
通过二代测序技术发现肝癌血清中存在众多差异表达miRNAs,经qRT-PCR检测及logistic回归分析,筛选出miR-769-5p和miR-4429为肝癌的有效诊断指标,ROC分析显示其具有较好的灵敏度和特异性,具备成为肝癌生物标志物的潜能。传统肿瘤标志物AFP的灵敏度和特异性较低,联合与miR-769-5p、miR-4429可以提高肝癌诊断的敏感度、特异性,对肝癌的发现、诊断有重要价值。
通过分析肝癌患者和健康对照血清miRNA表达谱,寻找差异表达的miRNAs并通过qRT-PCR技术予以验证,探讨经验证差异表达的miRNAs在肝癌诊断中的临床应用价值。
方法:
1.选取69例均经临床和病理确诊且尚未接受手术、化疗、放疗等任何临床治疗肝癌患者作为研究对象,详细收集患者的临床及实验室检查资料,同时选取慢性活动性乙肝患者47例、健康体检者40例作为对照。确定研究对象后,采集研究对象静脉血3ml,分离血清保存待用。
2.在实验对象中选取3例肝癌患者血清和3例正常对照者血清,构建小RNA测序文库,基于illumina测序技术平台,进行单端测序,获得有差异表达的miRNAs,对差异表达miRNAs进行靶基因预测和候选靶基因的确定。
3.选取部分显著性差表达的miRNAs作为研究指标,采用qRT-PCR技术检测肝癌血清、慢性活动性乙肝血清和正常对照血清中miRNAs表达水平。根据qRT-PCR检测结果,初步确定肝癌患者血清差异表达miRNAs并作其与肝癌的logistic逐步回归分析,最后确定有效的差异表达miRNAs。分析最终入选的miRNAs与肝癌患者临床特征及实验室检测指标的相关性。
4.应用ROC曲线分析miRNAs对肝癌的诊断价值,包括灵敏度、特异性、准确度、阳性预测值、阴性预测值等,评价肝癌传统标志物AFP单独及与miRNAs联合检测在肝癌的诊断中的价值。
5.统计学处理:采用SPSS16.0统计软件,实验数据以(-x±s)表示,采用单因素方差分析肝癌组、慢性活动性肝炎组和正常对照组之间miRNA的差异表达,P<0.05有统计学意义。用logistic回归逐步分析有差异表达的miRNA(选入标准α=0.05,剔除标准α=0.10),筛选出有诊断价值的miRNA,求出Logistic回归方程。用Spearman相关分析miRNA与各临床特征指标的关系,P<0.05为差异具有统计学意义。使用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析单个指标和多指标联合检测对肝癌的诊断价值。
结果:
1.在肝癌血清和正常对照血清中筛选出42个差异性表达miRNAs,其中35个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。部分差异表达miRNAs可能与基因转录、细胞代谢、细胞周期以及细胞凋亡等相关基因的调空有关。
2.肝癌组和慢性活动性乙肝组血清中miR-320c、miR-4429、miR-4532较正常对照组血清相对表达量有上升趋势,且差异具有显著性差异(P<0.05);miR-1290在三组血清中的相对表达量无显著性差异;肝癌组血清中miR-769-5p、miR-223-3P较慢性活动性乙肝组和正常对照组血清相对表达量有下降趋势,且差异具有显著性差异(P<0.05);慢性活动性乙肝组血清中miR-744-5p的相对表达量与肝癌组和正常对照组血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05),肝癌组血清中miR-744-5P的相对表达量与正常对照血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05);慢性活动性乙肝组血清中miR-150-5p的相对表达量与肝癌组和正常对照血清相比,相对表达量上升且有显著性差异(P<0.05)。
3.根据以上统计结果,将miR-320c、miR-769-5p、miR-223-3p、miR-744-5p、miR-4429共5个差异表达miRNA入选为logistic回归分析,最后将miR-769-5p和miR-4429共2个差异表达miRNA入选,并做回归方程:P=1/[1+e-(0.687-4.919X1+2.151X2)](方程中的X1、X2分别代表miR-769-5p和miR-4429的相对表达量)。miR-769-5p和miR-4429与肝癌患者临床病理在指标均无显著性相关(P>0.05)。
4.miR-769-5p、miR-4429和AFP单项检测和联合检测在诊断肝癌中的ROC曲线分析:在单项检测中,miR-769-5p的AUC(曲线下面积)为0.803(95CI:0.691~0.914,P<0.001),灵敏度最高;AFP的AUC为0.798(95CI:0.707~0.889,P<0.001);miR-4429的AUC为0.877(95CI:0.811~0.943,P<0.001),特异性最好;在联合检测中,miR-769-5p联合miR-4429的AUC为0.874(95CI:0.806~0.942,P<0.001);miR-769-5p联合AFP的AUC为0.929(95CI:0.880~0.977,P<0.001);miR-4429联合AFP的AUC为0.934(95CI:0.888~0.981,P<0.001);三者联合检测的的AUC为0.956(95CI:0.917~0.995,P<0.001),灵敏度和准确度均最高
结论:
通过二代测序技术发现肝癌血清中存在众多差异表达miRNAs,经qRT-PCR检测及logistic回归分析,筛选出miR-769-5p和miR-4429为肝癌的有效诊断指标,ROC分析显示其具有较好的灵敏度和特异性,具备成为肝癌生物标志物的潜能。传统肿瘤标志物AFP的灵敏度和特异性较低,联合与miR-769-5p、miR-4429可以提高肝癌诊断的敏感度、特异性,对肝癌的发现、诊断有重要价值。