论文部分内容阅读
Poisson-Boltzmann方程常被用于复杂生物分子运动的模拟，但关键的难点在于跟踪生物分子界面的运动，由于水平集方法是跟踪界面运动和界面拓扑变化的经典方法，本文就将两者结合起来数值模拟复杂生物分子溶解现象。在本文中，我们构造出3D Immersed finite element method（三维浸入有限元方法）求解Poisson-Boltzmann方程的数值解，达到近似二阶的数值逼近精度，并且用水平集方程来跟踪溶质溶剂界面，数值模拟出生物分子界面的运动。最后，通过数值例子验证我们的数值方法的有效性。