全基因组关联性分析确定的基因位点与阿尔茨海默病影像学标志物相关性分析

• 作 者: 李洁琼
• 机 构: 青岛大学
• 出 处: 青岛大学
• 发表日期: 2016年4期
• 关键词: 阿尔茨海默病

背景：一项大范围关联分析发现了19个对晚发型阿尔茨海默病（AD）具有重要影响的基因组区域。这项发现印证了之前老年痴呆症病理学涉及到的几个途径，包括免疫反应、炎症、细胞迁移和类脂运输通路。然而，它们是否影响AD影像学标志物，还不明确。
　　方法：我们的研究人群来自阿尔茨海默病神经影像计划（ADNI）数据库。我们选择了六个与AD高度相关的脑区（海马、中颞叶、杏仁核、海马旁回、颞下叶、顶下小叶）作为目标脑区。对于以上六个脑区，我们研究了其Aβ沉积、葡萄糖代谢率以及磁共振下脑结构的改变情况与包括APOEε4在内的一共20个位点的相关性。我们不但对基线人群的相关性做了研究，而且还对该人群做了两年的随访，并检测两年内诸影像标志物的变化率与位点的相关性。然而，其中12个位点，我们无法从ADNI数据库中直接获得，于是我们从“国际千人基因组计划”中选择与之最为高度连锁不平衡的位点作为替代。矩阵研究显示各个脑区之间是相互独立的。我们使用累加模型进行基因型数据分析，影像学分析我们使用了线性回归模型。另外，我们应用了年龄、性别、教育程度、APOE基因型、颅内容积作为校正因素。在经过错误发现率（FDR）校正之后，我们认为P值小于0.05，结果具有统计学效力。
　　结果：我们从ADNI数据库中选取的研究对象中有261名认知功能正常的人，456名轻度认知功能障碍的人以及47名AD患者。我们研究发现：经过两年的随访，MS4A6A基因rs983392位点和SOLR1基因rs11218343位点与左侧颞下叶的体积的变化率密切相关(FDR校正后，P=0.002067)。SORL1基因rs720099位点与左侧海马旁回体积的变化率密切相关。与此同时，SOLR1基因rs11218343位点和BIN1基因rs6733839位点分别与左侧海马和右侧顶下小叶的体积变化率相关。另外，在基线人群中，CR1基因rs6656401位点和MS4A6A基因rs983392位点都与小的右侧中颞叶体积有关。然而，除了APOEε4之外，我们没有发现任何与葡萄糖代谢和Aβ沉积有关的位点。而APOEε4几乎与所有的影像学生物标志物均有关。
　　结论：在20个与AD相关的位点中，有五个位点（CR1-rs6656401,MS4A6A-rs983392,SORL1-rs11218343,BIN1-rs6733839以及APOEε4）同时也与影像学标志物密切相关。