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越来越多的证据表明长链非编码RNA参与响应各种各样的逆境胁迫，包括生物胁迫和非生物胁迫。在拟南芥中，有1832个基因间长链非编码RNA的表达量已经被报道在受到干旱，寒冷，高盐或者是ABA胁迫处理2小时或者12小时后有显著性变化(Liu et al.，2012)。通过从拟南芥全基因组范围内研究发育表达和转录组鉴定的方法(Laubinger et al.，2008)，发现根部组织的基因表达与其他部位的表达有很大差别，因此，想主要研究根部特异性表达的长链非编码基因间RNA。我们已经鉴定出了一些长链非编码基因间RNA，它们只在根部大量表达，在叶或者其他组织表达量很低或者不表达，而且他们在受到各种胁迫（ABA胁迫，盐胁迫，渗透胁迫和冷胁迫）处理后高度被诱导。初步实验数据表明，这些长链非编码基因间RNA的表达能够同时受到ABA信号通路和PRC2复合物的调节。发现这些长链非编码基因间的RNA是能够双向转录的，而且两条链的转录都受到ABA和盐胁迫的诱导。发现这些长链非编码RNA能够通过某种未知的机制调节其邻近基因的表达，这种机制也正是本课题想要弄清楚的问题。最后，基因间长链非编码RNA的knockdown突变体和T-DNA突变体在ABA和盐胁迫处理时，与对照组相比，都呈现出敏感或者抵抗的表型，这些结果表明，长链非编码基因间RNA在植物逆境耐受方面起着至关重要的作用。总而言之，这种现象能够给研究者带来新的思考，通过改变基因间长链非编码RNA的表达量或者是时空表达模式就能培育出对逆境胁迫高抗的植物。