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目的:1.探讨中国高血压人群中同型半胱氨酸代谢通路相关基因腺苷高半胱氨酸水解酶基因(AHCY)、胱硫醚β合成酶基因(CBS)、二氢叶酸还原酶基因(DHFR)、亚甲基四氢叶酸脱氢酶1基因(MTHFD1)和丝氨酸羟甲基转移酶1基因(SHMT1)DNA启动子区甲基化与缺血性脑卒中的关联;2.进一步探讨AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1、SHMT1基因启动子区甲基化对缺血性脑卒中的潜在诊断价值,以及联合不同基因能否提高缺血性脑卒中的诊断价值。
方法:1.选择383名高血压患者(以下简称高血压组)及177名高血压并发缺血性脑卒中患者(以下简称脑卒中组),采用统一的方案来收集研究对象的基线资料。
2.提取外周血DNA,采用荧光定量甲基化特异性PCR测量AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1和SHMT1基因启动子区甲基化水平。
3.采用Mann-Whitney U检验比较两组间目的基因甲基化水平差异,采用Logistic回归模型和ROC曲线进一步分析AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1和SHMT1基因启动子甲基化水平与缺血性脑卒中的关系及评估预测缺血性脑卒中发病的效果。
4.采用双荧光素酶报告基因实验探究目的基因片段调控基因表达能力。
5.利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中左右颈动脉内皮细胞数据来验证目的基因甲基化与基因表达间关联。
结果:1.MTHFD1,CBS,DHFR,AHCY基因甲基化水平在脑卒中组均低于高血压组(All P<0.01),中位数和四分位数分别为5.41(3.15-7.53)vs.10.16(6.61-14.00)、33.70(19.34-51.52)vs.50.06(27.74-70.60)、9.11(2.81-16.20)vs.24.94(7.16-56.45)和0.01(0-0.06)vs.0.03(0-0.19)。此外SHMT1基因甲基化水平在脑卒中组为24.79(16.95-35.36)和高血压组的25.73(13.88-39.29)差异无统计学意义(P=0.337)。
2.Logistic回归模型显示MTHFD1,CBS,DHFR是高血压患者并发缺血性脑卒中的保护因素,OR(95%CI)分别为0.713(0.629-0.808)、0.976(0.958-0.995)、和0.946(0.916-0.977)。
3.ROC曲线显示MTHFD1基因甲基化预测缺血性脑卒中发病效果最佳,在总人群中AUC和95%CI为0.808(0.746-0.870),其中男性为0.879(0.800-0.958),女性为0.759(0.664-0.852)。而CBS,DHFR,SHMT1基因甲基化只在女性中预测效果较佳,AUC分别为0.744(0.644-0.845)、0.772(0.680-0.864)和0.721(0.617-0.825)。CBS,DHFR,和MTHFD1三个基因联合预测高血压患者缺血性脑卒中发病的效果最佳,AUC和95%CI可达到0.871(0.828-0.914)。
4.双荧光素酶报告基因实验结果显示,插入的SHMT1,MTHFD1和AHCY片段具有启动功能(P=0.003,P=0.009,P=0.003),此外,虽然DHFR,CBS不具有直接启动功能,但具有调节启动功能。
5.GEO数据集GSE56143结果显示,左颈动脉内皮细胞的SHMT1和MTHFD1基因表达水平在加入去甲基化处理5-AZA后轻度上调,差异有统计学意义(P=0.032和P=0.006)。右颈动脉内皮细胞的SHMT1、DHFR、AHCY和MTHFD1的基因表达水平在加入去甲基化处理5-AZA后上调,差异有统计学意义(P=0.028,P=0.010,P=0.015和P=0.012)。
结论:1.MTHFD1,CBS,DHFR,AHCY基因甲基化水平在脑卒中组均低于高血压组,SHMT1基因甲基化水平在脑卒中组与高血压组差异无统计学意义。
2.MTHFD1,CBS,DHFR基因低甲基化是高血压患者并发缺血性脑卒中的保护因素,AHCY,SHMT1基因甲基化与缺血性脑卒中不相关。
3.MTHFD1基因低甲基化对缺血性脑卒中预测效果最佳。而CBS,DHFR,SHMT1基因甲基化在女性中预测效果较佳。联合CBS,DHFR,MTHFD1三个基因对缺血性脑卒中的预测效果最佳。
4.SHMT1,MTHFD1和AHCY目的片段具有启动功能,而DHFR,CBS虽然不具有直接启动功能,但具有调节启动功能。
5.目的基因甲基化能够调控基因表达。
方法:1.选择383名高血压患者(以下简称高血压组)及177名高血压并发缺血性脑卒中患者(以下简称脑卒中组),采用统一的方案来收集研究对象的基线资料。
2.提取外周血DNA,采用荧光定量甲基化特异性PCR测量AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1和SHMT1基因启动子区甲基化水平。
3.采用Mann-Whitney U检验比较两组间目的基因甲基化水平差异,采用Logistic回归模型和ROC曲线进一步分析AHCY、CBS、DHFR、MTHFD1和SHMT1基因启动子甲基化水平与缺血性脑卒中的关系及评估预测缺血性脑卒中发病的效果。
4.采用双荧光素酶报告基因实验探究目的基因片段调控基因表达能力。
5.利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中左右颈动脉内皮细胞数据来验证目的基因甲基化与基因表达间关联。
结果:1.MTHFD1,CBS,DHFR,AHCY基因甲基化水平在脑卒中组均低于高血压组(All P<0.01),中位数和四分位数分别为5.41(3.15-7.53)vs.10.16(6.61-14.00)、33.70(19.34-51.52)vs.50.06(27.74-70.60)、9.11(2.81-16.20)vs.24.94(7.16-56.45)和0.01(0-0.06)vs.0.03(0-0.19)。此外SHMT1基因甲基化水平在脑卒中组为24.79(16.95-35.36)和高血压组的25.73(13.88-39.29)差异无统计学意义(P=0.337)。
2.Logistic回归模型显示MTHFD1,CBS,DHFR是高血压患者并发缺血性脑卒中的保护因素,OR(95%CI)分别为0.713(0.629-0.808)、0.976(0.958-0.995)、和0.946(0.916-0.977)。
3.ROC曲线显示MTHFD1基因甲基化预测缺血性脑卒中发病效果最佳,在总人群中AUC和95%CI为0.808(0.746-0.870),其中男性为0.879(0.800-0.958),女性为0.759(0.664-0.852)。而CBS,DHFR,SHMT1基因甲基化只在女性中预测效果较佳,AUC分别为0.744(0.644-0.845)、0.772(0.680-0.864)和0.721(0.617-0.825)。CBS,DHFR,和MTHFD1三个基因联合预测高血压患者缺血性脑卒中发病的效果最佳,AUC和95%CI可达到0.871(0.828-0.914)。
4.双荧光素酶报告基因实验结果显示,插入的SHMT1,MTHFD1和AHCY片段具有启动功能(P=0.003,P=0.009,P=0.003),此外,虽然DHFR,CBS不具有直接启动功能,但具有调节启动功能。
5.GEO数据集GSE56143结果显示,左颈动脉内皮细胞的SHMT1和MTHFD1基因表达水平在加入去甲基化处理5-AZA后轻度上调,差异有统计学意义(P=0.032和P=0.006)。右颈动脉内皮细胞的SHMT1、DHFR、AHCY和MTHFD1的基因表达水平在加入去甲基化处理5-AZA后上调,差异有统计学意义(P=0.028,P=0.010,P=0.015和P=0.012)。
结论:1.MTHFD1,CBS,DHFR,AHCY基因甲基化水平在脑卒中组均低于高血压组,SHMT1基因甲基化水平在脑卒中组与高血压组差异无统计学意义。
2.MTHFD1,CBS,DHFR基因低甲基化是高血压患者并发缺血性脑卒中的保护因素,AHCY,SHMT1基因甲基化与缺血性脑卒中不相关。
3.MTHFD1基因低甲基化对缺血性脑卒中预测效果最佳。而CBS,DHFR,SHMT1基因甲基化在女性中预测效果较佳。联合CBS,DHFR,MTHFD1三个基因对缺血性脑卒中的预测效果最佳。
4.SHMT1,MTHFD1和AHCY目的片段具有启动功能,而DHFR,CBS虽然不具有直接启动功能,但具有调节启动功能。
5.目的基因甲基化能够调控基因表达。