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该论文研究目的是以单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)为遗传标记、以PCR-RFLP为方法来研究中国地方鸡种与国外鸡种(蛋鸡、肉鸡)间的遗传差异及多样性.该研究是第一次以23个中国地方鸡种与3个国外鸡种(2个肉鸡品种隐性白洛克鸡和罗曼鸡及1个蛋鸡品种莱航鸡)共762个个体为试验材料,以鸡生长轴上10个基因中的22个多态位点为对象研究鸡的遗传多样性.通过基因型信息,统计每个SNPs在各群体中的等位基因频率,所得结果用于更进一步的分析.每个多态位点都检测到2个等位基因,呈现出高度的遗传变异.在全部个体中所有SNPs的合子平均比例为0.3680.在中国地方鸡种中阳山鸡表现出最低的遗传变异(0.2522);略阳鸡表现出最高的遗传变异(0.3594);蛋鸡遗传变异系数为0.2576;肉鸡中最高为0.3348,最低为0.2937;所有群体平均的基因变异为0.3098.用SNPs分析群体间的进化关系时,发现中国地方鸡种间的关系要近些,而所有中国地方鸡种与莱航鸡的关系更远些.中国地方鸡种与莱航鸡间的遗传距离从矮脚黄与莱航鸡之间的0.1017到泰和丝羽乌骨鸡之间的0.2891大小不等.同时发现,所有中国地方鸡种与罗曼鸡几乎没有关系,它们间的遗传距离很小,从矮脚黄与罗曼鸡之间的0.0093到泰和丝羽乌骨鸡之间的0.0977.进化分析发现中国地方鸡种与蛋鸡间的重要进化分歧.这与以前的研究得出的结果一致,Zhang等(2002)用等位酶、RAPD和微卫星多态研究也发现中国地方鸡种与蛋鸡有很大的进化分歧.商品肉鸡与中国地方鸡种聚为一类,显示它们具有共同的特异的等位基因.个体进化树证实了某些由群体进化树得到的特征,并明显地体现了来自于不同品种的个体间的相关性.隐性白洛克鸡与中国地方鸡种东乡鸡的1个体有很近的关系,表明这2个群体具有共同的遗传组成.当一系列的分析分开考虑时,特异的鸡品种群体结构很明了.某些特定品种的同源结构也被反映在个体进化分析上,用可观测的微卫星等位基因频率模拟研究品种标记时也支持此发现.