【摘 要】
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DNA计算是一门新的学科.为了能够从一般的角度来考虑DNA自装配的能力,建立一个自装配的抽象的模型是很有必要的.这里,我们利用信息几何的知识给出了DNA自装配的一个形式化模
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DNA计算是一门新的学科.为了能够从一般的角度来考虑DNA自装配的能力,建立一个自装配的抽象的模型是很有必要的.这里,我们利用信息几何的知识给出了DNA自装配的一个形式化模型,以分子两两构成的组合的个数为分量组成的向量表示自装配过程中的一个状态,那么,当每日装配系统达到平衡时,就有一个关于这些状态的一个概率分布,所有可能的概率分布形成了一个微分流形S.自装配系统在平衡时真正达到的关于状态的概率分布构成了S的子流形A.这样不同自装配模型之间的内蕴距离就对应S上两分布间的散度,若事先给定一个分布,则在平衡时对应概率分布最接近这一分布的自装配系统由给定分布在S上的点在 A上的投影给出,由此讨论了能够在平衡时产生与给定分布最为接近的分布的自装配模型应满足的条件.利用此形式化模型,我们给出了一种机制,使得自装配系统平衡时某些分子组合占优势.
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