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鱼类物种的鉴定和描述是鱼类分类学的基础。本文以在我国沿海采集的鱼类标本和国内主要标本馆的馆藏标本为基础，对鳎亚目两种鱼类和鲈形目鹦嘴鱼科鱼类进行了分类研究。
依据李思忠和王惠民1995年的分类系统，鲽形目分为三个亚目，包括鳒亚目(Psettodoidei)、鲽亚目(Pleuronectoidei)和鳎亚目(Soleoidei)。本文选择鳎亚目鳎科(Soleidae)的带纹条鳎（Zebriaszebrinus）为研究对象，对于其存在的不同种名及中国海域是否存在不同种类带纹条鳎的争议问题，应用形态及分子手段进行了研究，确定了我国海区带纹条鳎为一个种，并明确了种名，给出了详细的带纹条鳎种类。
对于在中国沿海的带纹条鳎是否是不同种的问题，本研究从北到南采集了15个地点的1107尾鱼类标本。形态鉴别特征包括可数和可量性状，共11项。通过多变量形态度量法获取带纹条鳎的体形数据，根据带纹条鳎的体形特点，在其有眼侧共设置了10个框架测量定位点，测量了15个数据。可数性状的特征值直接用于统计分析。对于可量性状和框架数据，为了消除规格大小对参数值的影响，我们均换算成了比例性状，最后整理为20个比例性状用于统计分析。
运用SPSS16.0软件中的系统聚类方法分别对可数性状和比例性状特征值的平均值进行聚类分析，得到聚类关系图用于分析群体间的关系;运用SPSS16.0软件对带纹条鳎15个群体的形态特征数据进行主成分分析。使用地理群体形态差异系数辅助物种有效性分析。结果表明我国沿海带纹条鳎的形态特征的变动范围在相邻群体间都是连续的，没有明显的断点;虽然广西两个群体与北方群体相比已经有一定程度的分化，但形态特征值的变动范围与相邻群体都是连续的，不存在种类的分化。
分子分析测定了14尾个体的COI条形码序列，计算了两两间的遗传距离为0-0.8％，平均值为0.4％，在以上所得的物种内遗传距离范围中，而远小于条鳎属物种间的COI-K2P，约为50-60倍。另外，22个D-loop序列间的遗传距离也只有0.7％-1.1％之间，平均值为0.8％，与COI-K2P相近，基于鱼类线粒体基因组中D-loop区的进化速率高于COI基因的进化速率，因此可以得出，带纹条鳎D-loop区的序列差异也应处在物种内的变异水平。遗传距离与地理距离的相关性分析也表明，两者之间没有必然的联系，因此，中国沿海的带纹条鳎没有达到种类间的分化。
带纹条鳎Z.zebra与Z.zebrinus的同物异名关系长期以来存在较大争议。本研究整理原始文献及核查柏林博物馆中的Zzebra的选模标本ZMB2423和荷兰生物多样性中心馆藏的Z.zebrinus的选模标本RMNHD.1308和副选模标本RMNHD.1306-1307，通过与原始文献的记述和模式标本特征的比较，确定我国沿海带纹条鳎的种名为Zebriaszebrinus(TemminckandSchlegel)，国内文献记录的Zebriaszebra(Bloch)为该种的同物异名。
近年来我们在华南沿海采样过程中发现一种带斑点的舌鳎属（Cynoglossus）鱼类，通过比较研究发现它与其他已知的舌鳎属鱼类都不相同，为舌鳎属一未定种(C.sp)。本研究首先对该种类的形态学特征的描述、可数性状与可量性状进行了分析，测量了37条来自广州湛江、海南三亚和陵水新村的标本的9个可量性状，计数了包括背鳍鳍条数、臀鳍鳍条数、尾鳍鳍条数、中侧线鳞数、背和中侧线间鳞数、背侧线外侧鳞数、脊椎骨数等的可数性状。根据舌鳎属鱼类种类分类的鉴别特征，对世界范围内记录的65种舌鳎属鱼类，包括中国沿海记录的26个种，进行了详细的比较研究，结果表明该未定种与所有上述65种鱼类存在着种类之间的差异。同时，本研究还进一步应用COI条形码的序列测定分析与26种舌鳎鱼类进行了分子鉴定分析，结果表明该种类与其他舌鳎鱼类的K2P遗传距离为0.155-0.263，已完全达到了利用条形码来辨别种类的水平。与断线舌鳎、考普斯舌鳎、东亚单孔舌鳎3个种的遗传距离在0.155-0.190，显著小于与斑头舌鳎等其他种类两两之间的遗传距离，但仍然达到了种类之间的分化程度，这也表明了南海舌鳎与这3个种有较近的亲缘关系。因此，根据形态和分子分析的结果，我们认为该种为一未记录种，暂定名为南海舌鳎（Cynoglossusnanhaiensis）。
鲈形目鹦嘴鱼科(Scaridae)鱼类是珊瑚礁生物多样性的重要组成之一。目前全世界已知的鹦嘴鱼科鱼类有2亚科10属99种。我国大陆文献记录的鹦嘴鱼科鱼类包括8属40种，在这些已有的记录中，存在着一些同物异名及形态描述上的分歧。本文系统地总结了鹦嘴鱼科的研究历史和现状，比较了鹦嘴鱼科主要分类系统中的科下类群的划分，检测了我国相关单位的馆藏鹦嘴鱼科鱼类标本387尾，计有6属22种，在此基础上对中国海域的鹦嘴鱼科鱼类进行分类整理。通过对鹦嘴鱼标本的形态学研究，确定了我国鹦嘴鱼科鱼类的形态特征和各分类单元的有效鉴别特征及其代表种类。对以前分类鉴定和命名存在分歧的种进行厘定，剔除了4个属及15个种之中存在的同物异名并补充了台湾海域的种类，阐明了中国海域鹦嘴鱼科鱼类的种类组成和区系分布，结合文献考证编制了我国海域已记录的7属36种的鹦嘴鱼科鱼类的属、种检索表。为进一步进行鹦嘴鱼科鱼类的系统发育及演化研究提供基础，为鹦嘴鱼的资源保护和开发利用提供科学依据。