hOGG1基因启动子区嵌合型变异属频发事件并可能影响该区域疾病相关的多态性分析

来源 :中华医学会2012年医学遗传学年会暨全国第十一次医学遗传学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tutu321
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  嵌合体是指一个生物体或组织内遗传上不同细胞系的存在.体细胞嵌合体存在于个体的体细胞中,通常是体细胞产生突变的结果,主要出现于早期胚胎发育.单核苷酸多态性(SNP)位点作为重要的生物学标记,已在鉴别个体生物学特征、开展疾病风险关联分析中发挥了巨大作用.本研究中我们采用高分辨率溶解曲线(HRM)及PCR产物直接测序技术,对比分析了1050名2型糖尿病患者、1100名健康对照hOGG1基因5-UTR区DNA变异.发现,hOGG1基因5-UTR存在C.-53G>C,C-23A>G和C-18G>T单核甘酸多态性变异,且糖尿病患者这些多态性变异的检出频率明显高于正常对照,提示其构成糖尿病发生的风险因素.深入分析发现,我们检出C.-53G>C的10.71%(3/28)、C-23A>G的13.73%(7/51)和C-18G>T的2.27%(1/44)不是从胚系遗传获得,而是呈嵌合型的变异状态.这一结果得到后续PCR产物克隆测序、焦磷酸测序、建立体外嵌合体细胞模型及观察等多项现代基因分子生物学技术分析结果的支持.在突变基因测序分析中,嵌合型的突变等位基因峰值一般较低,易于被当作非特异性的杂峰而忽视.这可能影响疾病关联基因变异的分析结果,特别是在复杂性疾病弱相关基因变异的分析中,这种影响尤其可能出现.因此,充分注意到多态性变异中可能存在嵌合体的现象,对于真实揭示疾病风险与基因变异的关系具有十分重要的意义.
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