GMA诱导的16HBE恶性转化细胞相关差异LncRNA筛选及其研究

来源 :中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第六届换届大会暨第十八届全国学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yeka
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  目的:筛选GMA 诱导的16HBE 恶性转化细胞(第30 代)相关差异表达LncRNA及其相关mRNA,探讨差异表达的LncRNA 在GMA 诱导的16HBE 恶性转化细胞中的表达水平及意义.方法:收获经8 μg/mL GMA 诱导的16HBE 恶性转化第30 代细胞及同代龄DMSO 溶剂对照组细胞,应用高通量LncRNA 芯片比较两组样本表达谱的差异,通过差异倍数、邻近编码基因信息分析等策略初步筛选出GMA 诱导的16HBE 恶性转化第30 代细胞中差异表达LncRNA及其最可能的蛋白质编码基因(mRNA),采用实时荧光定量PCR(qPCR)和全基因组表达谱芯片分析差异表达LncRNA 和mRNA 的表达量,并与同代龄DMSO 溶剂对照组细胞比较.结果:LncRNA 芯片结果显示,与DMSO 组相比,GMA 诱导的16HBE 恶性转化第30代细胞中筛选出2664 个差异表达的LncRNA 及2216 个差异表达LncRNA 相关的mRNA;差异表达的LncRNA 中PCA3、CTBP1-AS1 和CDKN2B-AS1 表达分别上调7.17、2.20 和5.39 倍,qPCR 结果显示,PCA3、CTBP1-AS1 表达量与芯片结果一致(P<0.05),全基因组表达谱芯片显示PRUNE2 下调,CTBP1 上调,与LncRNA 芯片结果一致.结论:LncRNAPCA3、CTBP1-AS1 可作为GMA 诱导的16HBE 恶性转化细胞中相关特异分子标志.
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