Optimization Algorithm for Creating A DNA Fingerprint Library By Computer

来源 :The XVI International Symposium on Apricot Breeding and Cult | 被引量 : 0次 | 上传用户:kmj
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  To develop a DNA fingerprint library for distinguishing cultivars,an algorithm was proposed to get the minimum combination of the DNA fingerprinting,and the validity of algorithm was verified by real dataset of SSR and AFLP.The results obtained by the algorithm were proved to be accurate,reliable.Compared to manual analysis,computer can finish the whole process in a few seconds.130 apricot cultivars can be distinguished by at least four pairs of primer of SSR.Only one pair of primer of AFLP can distinguish 150 apricot cultivars.AFLP was more suitable for cultivars identification than SSR.The parameters such as a percentage of distinguishing cultivars by primers(Sscore),and a frequency of a primer in primer combinations(Fq)can be got to further analyze their biological significance.
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