【摘 要】
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目的 分析上海市金山区2017—2018年分离的柯萨奇病毒A组6型(CoxA6)VP1基因特征和氨基酸位点突变,为手足口病防控提供依据.方法 对金山区2017—2018年采集并分离到16株CoxA6
【机 构】
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上海市金山区疾病预防控制中心,上海,201599
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目的 分析上海市金山区2017—2018年分离的柯萨奇病毒A组6型(CoxA6)VP1基因特征和氨基酸位点突变,为手足口病防控提供依据.方法 对金山区2017—2018年采集并分离到16株CoxA6分离株VP1全长基因进行扩增、测序、 序列比对,构建系统发生树,分析核苷酸和氨基酸同源性以及氨基酸位点突变.结果 金山区16株CoxA6分离株均属于E2亚型同一个进化分支,16株间VP1基因核苷酸同源性为92.3％～97.7％,氨基酸同源性为98.4％～100.0％.与金山区16株分离株同源性最高的是2018年山东分离株MK357081/CHN/SD/JN/2018,核苷酸和氨基酸同源性分别为95.7％～99.3％和98.7％～99.7％.13株CoxA6分离株VP1氨基酸序列存在氨基酸位点变异,涉及8个氨基酸变异位点,但在抗原表位重要位点201D、243H、245R、247Y、248M和249R均未检测到抗原漂移.结论 16株CoxA6分离株核苷酸和氨基酸序列高度同源且位于E2亚型同一进化分支;CoxA6 E2亚型可能是金山区2017—2018年流行的主导基因型,金山区CoxA6 VP1存在氨基酸突变位点但未涉及关键的抗原表位.
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