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对7种哺乳动物MHC DQA座位的23个等位基因不同外显子,抗原识别位点和EN2的非ARS的核苷酸同义替换率和异义替换率进行了分析,发现在HLA-DQA1的7个等位基因之间和Ia Aa8个等位基因之间,即同一物种DQA1座位内,ARS的PN均显著高于Ps2倍以上,表现超显性选择;而不同物种DQA基因(DQA1或DQA2)或同一物种的DQA基因(DQA1和DQA2)的ARS之间和各比较组的NAEN2