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钩端螺旋体病在我国大部分地区有散发或流行。本例患者急性起病，发热伴咳嗽，未见消化道异常表现，出现多器官功能障碍综合征，多种病原学检查结果为阴性，脑脊液感染病原菌高通量基因检测为钩端螺旋体，考虑为钩端螺旋体病，接受头孢曲松钠治疗后，症状改善，异常指标完全恢复。对于发热待查患者，临床医师要重视疫水接触史，关节肌肉酸痛、腓肠肌压痛等特异表现，有条件者积极采用新型检查方法，避免漏诊、误诊。