【摘 要】
：
为鉴定烟草中bZIP转录因子并验证其部分基因在非生物胁迫诱导中的响应机制,本研究基于最新的烟草基因组测序结果对bZIP基因家族进行了全基因组鉴定及生物信息学分析,并在ABA
【机 构】
：
四川农业大学农学院,成都,611130
论文部分内容阅读
为鉴定烟草中bZIP转录因子并验证其部分基因在非生物胁迫诱导中的响应机制,本研究基于最新的烟草基因组测序结果对bZIP基因家族进行了全基因组鉴定及生物信息学分析,并在ABA处理下对其A亚族的18个基因进行了转录水平检测.结果 表明,利用基于隐马尔可夫模型的Hmmer软件和Pfam的在线蛋白结构预测,在烟草全基因中总共鉴定得到105个包含bZIP保守结构域的基因,其蛋白序列长度分布为112～973,蛋白分子量分布为12 913.63～104 640.38 Da,保守结构域序列长度在35～59,等电点分布在4.91～9.79,都属于亲水蛋白.对获得的全部烟草bzip家族序列构建系统进化树,以拟南芥的71个bZIP序列为对照,将其划分为10个亚族,即A～I和S.通过MEME在线软件预测出烟草bZIP基因家族有20个模体结构,其中motif1普遍存在于103个蛋白之中,每一个亚族中模体的种类和数目都是相似的,说明了亚族分组的可靠性.通过对普通烟草在ABA处理下bZIP基因家族中的A亚族基因的转录水平表达模式分析表明,18个基因受到诱导表达,表达量均出现上调,但最大值出现的时间不同,说明bZIP A亚族基因应对ABA处理时具有一定的共性,但是具体的响应模式不同.
其他文献
为筛选出彩色马蹄莲不同品种和组织最佳内参基因,以彩色马蹄莲不同品种和不同组织为研究材料,运用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)结合3个内参基因稳定性分析软件(geNorm,NormF
为研究辣椒果实不同发育时期着色的基因表达差异,探究参与或调控辣椒果实类胡萝卜素合成的基因或转录因子.本研究采用RNA-Seq技术对辣椒果实青果期(G)、转色期(B1,果实表面30
目的：研究养荣润肠舒合剂对肛肠科术后便秘的临床疗效。方法：将144例混合痔术后便秘患者随机分为观察组与对照组,分别应用养荣润肠舒合剂及麻仁软胶囊治疗。结果：观察组疗效明显
直肠前突又称直肠前膨出,为出口梗阻综合症之一,多见于中老年经产妇,其主要临床表现是粪便排出困难。该院开展经阴道切开补片修补治疗中、重度直肠前突68例病人,术后经过近期
2009年2月3日下午4时,随着天门市人大常委会会议室电子表决系统表决倒计时结束,屏幕上显示“通过”二字时,会场上顿时掌声雷动,《天门市人大常委会关于同意
At 3:00 p.m. on
为了剖析大豆GmCBL10在盐胁迫下的表达模式,本研究采用PCR技术从‘东农50’中克隆了GmCBL10基因全长序列,由792个碱基组成,共编码263个氨基酸。生物信息学分析发现Gm CBL10不
植物密码子偏好性的研究在解析物种机体进化发展和引入外源基因方面都有重要意义.为研究台湾金线莲(A noectochilus roxburghii)和福建金线莲似noectochilus formosanus)密码
排便障碍主要表现是便秘和排便困难,女性多见。结肠、直肠肛管和盆底多种疾病可以引起便秘和排便困难,必须作出病因学的疾病诊断。除病史,查体,化验,钡灌肠摄片外,大肠内窥镜
应北京市科协邀请,日本热处理技术协会常务理事、工学博士、金属加工技术士大和久重雄先生,继在沈阳讲学之后,于九月十八日到京,九月十八日至二十四日在北京市劳动人民文化
为建立可靠并且稳定的SRAP-PCR反应体系,进一步开展新疆薰衣草种质资源的遗传多样性研究提供帮助.本研究采用L16(45)正交试验设计方法,对薰衣草SRAP-PCR反应体系主要影响因素