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目前对功能性消化不良的药物治疗尚无特异性，患者的个体差异也比较大。对于功能性消化不良患者的治疗途径主要应以患者病理、生理、心理的改变作为根本，遵循个体化用药治疗的原则。促动力药和酸抑制剂仍是对功能性消化不良患者在药物治疗中的主要药物，精神心理疗法、生活方式的改变、饮食习惯的培养等等对功能性消化不良患者也具有非常重要的作用，应引起高度重视。