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浙江大学医学院附属第一医院传染病学科始建于1956年。经过几代人50余年的艰苦创业，逐步发展壮大，特别是在近10年，学科发展突飞猛进，迄今已成为在国内外具有较大影响和重要学术地位的一流学科，系国家内科学（传染病）重点学科，国家教育部原“211工程”和原“985工程”重点学科建设单位，国务院首批博士学位点、博士后流动站。
2007年4月，在国家科技部、教育部、原卫生部和浙江省委、省政府的大力支持下，浙江大学提出建设传染病诊治国家重点实验室的申请，2007年9月，建设计划通过国家科技部专家组的论证，2007年10月，实验室正式获得批准建设。传染病诊治国家重点实验室依托浙江大学和国家传染病学重点学科，由国家科技部主管，教育部托管，目前正处于建设期。
创新为主，成果丰硕
从一定意义上讲，人类的历史就是与各种传染病斗争的历史。在人类历史发展的较长时期内，传染病流行面广、发病率高、病死率高，给人类的生存、生活、生产等造成了诸多严重影响。随着我国经济的持续稳定发展，人民生活水平的不断提高，预防、医疗、保健体制的不断完善，多种经典传染病的发病率呈明显下降趋势，有些已属罕见甚至绝迹。
然而，艾滋病、传染性非典型肺炎、人类禽流感及人类猪链球菌感染等新发感染病，耐药菌感染，机会性感染，医院内感染已成为严重的公共卫生问题，人类感染性疾病谱已发生重大改变。这种变化给传染学临床、科研及教学工作带来了很大挑战。
传染病诊治国家重点实验室融科研、医疗、教学为一体，定位于传染病学诊断与治疗的基础研究与临床应用研究，针对我国传染病现状，依据国家对重大传染病防治的战略规划，围绕传染病的诊断和治疗等科学前沿问题开展研究，重点研究解决严重危害人类健康的传染病发病机制与诊治的关键问题。
实验室的主要研究方向和内容包括：病毒性肝炎发病机制及新型防治技术研究，应用系统生物学、实验动物学、再生医学、药物治疗学的最新技术，重点在病毒性肝炎发病机制研究、肝炎病毒变异与耐药机制的研究、人工肝基础和应用研究领域开展研究;艾滋病等新发与再现传染病研究，在艾滋病/HIV感染、禽流感等疾病的防治、其他新发与再现传染病防治等方面进行重点研究;感染微生态和感染免疫研究，重点对微生态与人类感染性疾病的关系、肝病微生态、重要病原体耐药机制及机会性感染、感染免疫的细胞和分子机制等方面进行研究;传染病诊断新技术研究，重点在高通量、灵敏、精确、快速的新型诊断技术，高效、可靠、安全的新发传染病病原体分离技术和设备，传染病特异性细胞免疫诊断技术，以及传染病相关的分子影像学等方面进行研究;传染病治疗的新技术与药物研究，将重点开展新型治疗技术、传染病治疗新合成药及现代中药的创制、抗感染药物不良反应等方面的研究。
实验室在传染病治疗和诊断方面取得的主要研究成果有：
1.人工肝研究处于国际领先水平。针对重型肝炎病死率高的难题，历经多年攻关，创建了一套独特有效具有自主知识产权的人工肝支持系统，探索确定人工肝在治疗过程中的各种参数，攻克了人工肝基础和应用中一系列的技术难关;探明了人工肝治疗的适应证和禁忌证，极大地降低了患者病死率。
2.感染微生态学的建立及应用研究。将微生态学理论引入感染和肝病研究领域，创建了“感染微生态”学新理论，对肝病微生态和细菌耐药进行了系列研究，提出了感染微生态防治新策略：用微生态学的理论和方法研究感染的发生、发展及转归过程，发现破坏人体微生态平衡会导致严重感染或脏器损害，该发现更新了抗感染策略。
3.病毒性肝炎研究方面。发现戊肝病毒新的抗原表位，探明病毒抗体的诊断意义，率先观察病毒血症及粪便排病毒规律，明确戊肝临床隔离时间。
4.传染病的诊断新技术研究获得丰硕成果。发明了特异探针标记新方法，研制了一系列特异性高、通量更大的诊断芯片。
这些重要的研究进展和成果先后荣获国家科技进步奖一等奖1项，创新团队1项、二等奖2项和省科技进步一等奖7项，其他奖励上百项;发表了Nature、Lancet、NEJM等一大批高质量的学术论文;主编《传染病学》《人工肝脏》《感染微生态》《人类病毒性疾病》等教材和论著数十部;获得国家发明专利授权数十项，并取得了良好的经济效益和社会效益。
重视人才，加强合作
实验室拥有在国际上具有一定影响、基础与临床结合紧密、不同学科专业优势互补的科技人才队伍，包括原“973计划”首席科学家、“长江”特聘教授和“国家杰出青年”等一批思路活跃、勇于探索创新的青年骨干，形成了院士领衔、教授支撑、青年骨干为主体的学术梯队和年龄与知识结构合理、学历层次高、专业覆盖面广、技术力量雄厚的学术队伍。实验室现有两院院士3人，国家杰出青年基金获得者5人，长江学者3人，春晖计划学者1人，国家和省有突出贡献中青年专家7人，省“151”人才10余人。实验室85%以上的研究人员具有博士学位。
实验室建立了分子生物学、蛋白质组学、代谢组学、生物信息学等12个研究平台，建有生物全实验室和20个相关的研究室，面积达7000余平方米，拥有60余台（套）高精尖大型仪器设备，价值6000余万元。实验室实行“开放、竞争、流动、联合”的运行机制，对国内外科研单位和大专院校开放各研究平台。实验室承担了国家重大科技攻关、原“973”计划、原“863”计划等一大批国家及省、部级项目，2018年实验室科研成果斐然，承担国家科技重大专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金重大项目等课题107项，总合同经费逾4.3亿元，到位经费2亿元，牵头千万元级以上项目11项，发表SCI论文133篇。实验室组织修改并发布了既符合中国特色又与国际接轨的《肝衰竭诊治指南（2018版）》，还提出“消除乙肝，我们共行动”的倡议，并得到国家卫健委的批示：总结示范区经验，全国推广。
除此之外，实验室还积极与国内外知名大学、研究院所进行广泛的合作與交流，多次应邀在国际重大学术会议上作专题报告，主办或承办大型国际会议，提升了实验室的国际学术地位。
如今，实验室传染病学科已是国内综合医院同类学科中规模最大的临床医疗科室之一。实验室的病区面积达2万余平方米，开放床位数300张，建有人工肝治疗中心、重症监护病房、感染性疾病、病毒性肝炎、结核病和艾滋病等10个诊疗病区。实验室收治病种齐全，病人来源广泛，医疗服务立足浙江，辐射全国乃至国际。其创建的人工肝支持系统等多项具有核心竞争力的临床诊治技术在治疗重型肝炎领域取得重大突破，并广泛推广至全国30省市300余家医疗单位，保证了学科在该领域的国际领先地位。
在依托单位浙江大学的有力支持下，传染病诊治国家重点实验室将继续紧密结合国家重大专项，结合国家传染病防治的长远战略和现实需要，针对传染病病原体诊断和重要传染病治疗的关键问题，开展开拓性研究，进一步增强自主创新能力，承担相关重大理论研究、高新技术研究及高水平人才培养工作，努力在传染病诊治方面取得突破性的创新成果，把实验室建设成为具有原始创新能力的国际先进的科学研究和人才培养基地。
2007年4月，在国家科技部、教育部、原卫生部和浙江省委、省政府的大力支持下，浙江大学提出建设传染病诊治国家重点实验室的申请，2007年9月，建设计划通过国家科技部专家组的论证，2007年10月，实验室正式获得批准建设。传染病诊治国家重点实验室依托浙江大学和国家传染病学重点学科，由国家科技部主管，教育部托管，目前正处于建设期。
创新为主，成果丰硕
从一定意义上讲，人类的历史就是与各种传染病斗争的历史。在人类历史发展的较长时期内，传染病流行面广、发病率高、病死率高，给人类的生存、生活、生产等造成了诸多严重影响。随着我国经济的持续稳定发展，人民生活水平的不断提高，预防、医疗、保健体制的不断完善，多种经典传染病的发病率呈明显下降趋势，有些已属罕见甚至绝迹。
然而，艾滋病、传染性非典型肺炎、人类禽流感及人类猪链球菌感染等新发感染病，耐药菌感染，机会性感染，医院内感染已成为严重的公共卫生问题，人类感染性疾病谱已发生重大改变。这种变化给传染学临床、科研及教学工作带来了很大挑战。
传染病诊治国家重点实验室融科研、医疗、教学为一体，定位于传染病学诊断与治疗的基础研究与临床应用研究，针对我国传染病现状，依据国家对重大传染病防治的战略规划，围绕传染病的诊断和治疗等科学前沿问题开展研究，重点研究解决严重危害人类健康的传染病发病机制与诊治的关键问题。
实验室的主要研究方向和内容包括：病毒性肝炎发病机制及新型防治技术研究，应用系统生物学、实验动物学、再生医学、药物治疗学的最新技术，重点在病毒性肝炎发病机制研究、肝炎病毒变异与耐药机制的研究、人工肝基础和应用研究领域开展研究;艾滋病等新发与再现传染病研究，在艾滋病/HIV感染、禽流感等疾病的防治、其他新发与再现传染病防治等方面进行重点研究;感染微生态和感染免疫研究，重点对微生态与人类感染性疾病的关系、肝病微生态、重要病原体耐药机制及机会性感染、感染免疫的细胞和分子机制等方面进行研究;传染病诊断新技术研究，重点在高通量、灵敏、精确、快速的新型诊断技术，高效、可靠、安全的新发传染病病原体分离技术和设备，传染病特异性细胞免疫诊断技术，以及传染病相关的分子影像学等方面进行研究;传染病治疗的新技术与药物研究，将重点开展新型治疗技术、传染病治疗新合成药及现代中药的创制、抗感染药物不良反应等方面的研究。
实验室在传染病治疗和诊断方面取得的主要研究成果有：
1.人工肝研究处于国际领先水平。针对重型肝炎病死率高的难题，历经多年攻关，创建了一套独特有效具有自主知识产权的人工肝支持系统，探索确定人工肝在治疗过程中的各种参数，攻克了人工肝基础和应用中一系列的技术难关;探明了人工肝治疗的适应证和禁忌证，极大地降低了患者病死率。
2.感染微生态学的建立及应用研究。将微生态学理论引入感染和肝病研究领域，创建了“感染微生态”学新理论，对肝病微生态和细菌耐药进行了系列研究，提出了感染微生态防治新策略：用微生态学的理论和方法研究感染的发生、发展及转归过程，发现破坏人体微生态平衡会导致严重感染或脏器损害，该发现更新了抗感染策略。
3.病毒性肝炎研究方面。发现戊肝病毒新的抗原表位，探明病毒抗体的诊断意义，率先观察病毒血症及粪便排病毒规律，明确戊肝临床隔离时间。
4.传染病的诊断新技术研究获得丰硕成果。发明了特异探针标记新方法，研制了一系列特异性高、通量更大的诊断芯片。
这些重要的研究进展和成果先后荣获国家科技进步奖一等奖1项，创新团队1项、二等奖2项和省科技进步一等奖7项，其他奖励上百项;发表了Nature、Lancet、NEJM等一大批高质量的学术论文;主编《传染病学》《人工肝脏》《感染微生态》《人类病毒性疾病》等教材和论著数十部;获得国家发明专利授权数十项，并取得了良好的经济效益和社会效益。
重视人才，加强合作
实验室拥有在国际上具有一定影响、基础与临床结合紧密、不同学科专业优势互补的科技人才队伍，包括原“973计划”首席科学家、“长江”特聘教授和“国家杰出青年”等一批思路活跃、勇于探索创新的青年骨干，形成了院士领衔、教授支撑、青年骨干为主体的学术梯队和年龄与知识结构合理、学历层次高、专业覆盖面广、技术力量雄厚的学术队伍。实验室现有两院院士3人，国家杰出青年基金获得者5人，长江学者3人，春晖计划学者1人，国家和省有突出贡献中青年专家7人，省“151”人才10余人。实验室85%以上的研究人员具有博士学位。
实验室建立了分子生物学、蛋白质组学、代谢组学、生物信息学等12个研究平台，建有生物全实验室和20个相关的研究室，面积达7000余平方米，拥有60余台（套）高精尖大型仪器设备，价值6000余万元。实验室实行“开放、竞争、流动、联合”的运行机制，对国内外科研单位和大专院校开放各研究平台。实验室承担了国家重大科技攻关、原“973”计划、原“863”计划等一大批国家及省、部级项目，2018年实验室科研成果斐然，承担国家科技重大专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金重大项目等课题107项，总合同经费逾4.3亿元，到位经费2亿元，牵头千万元级以上项目11项，发表SCI论文133篇。实验室组织修改并发布了既符合中国特色又与国际接轨的《肝衰竭诊治指南（2018版）》，还提出“消除乙肝，我们共行动”的倡议，并得到国家卫健委的批示：总结示范区经验，全国推广。
除此之外，实验室还积极与国内外知名大学、研究院所进行广泛的合作與交流，多次应邀在国际重大学术会议上作专题报告，主办或承办大型国际会议，提升了实验室的国际学术地位。
如今，实验室传染病学科已是国内综合医院同类学科中规模最大的临床医疗科室之一。实验室的病区面积达2万余平方米，开放床位数300张，建有人工肝治疗中心、重症监护病房、感染性疾病、病毒性肝炎、结核病和艾滋病等10个诊疗病区。实验室收治病种齐全，病人来源广泛，医疗服务立足浙江，辐射全国乃至国际。其创建的人工肝支持系统等多项具有核心竞争力的临床诊治技术在治疗重型肝炎领域取得重大突破，并广泛推广至全国30省市300余家医疗单位，保证了学科在该领域的国际领先地位。
在依托单位浙江大学的有力支持下，传染病诊治国家重点实验室将继续紧密结合国家重大专项，结合国家传染病防治的长远战略和现实需要，针对传染病病原体诊断和重要传染病治疗的关键问题，开展开拓性研究，进一步增强自主创新能力，承担相关重大理论研究、高新技术研究及高水平人才培养工作，努力在传染病诊治方面取得突破性的创新成果，把实验室建设成为具有原始创新能力的国际先进的科学研究和人才培养基地。