【摘 要】
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目的 阐明长春市2009年手足口病(Hand Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的VP1编码区基因特征.方法 对从长春市2009年HFM
【机 构】
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长春市疾病预防控制中心,吉林长春,130033;吉林省疾病预防控制中心,吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062
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目的 阐明长春市2009年手足口病(Hand Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的VP1编码区基因特征.方法 对从长春市2009年HFMD患者分离到的7株EV71分离株,采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,用生物信息学软件Bioedit和Mega 4.0进行同源性、亲缘关系分析.结果 7株EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.5％～100％和98.6％～100％;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.1％～99.7％和98.6％～100％.7株分离株均属于C4a基因亚型,在基因亲缘关系树上处于两个相对独立的进化分支(较大进化分支Clade 1和较小进化分支Clade 2).结论 目前监测到的2009年致长春市HFMD流行的EV71为C4a基因亚型,并且至少有2个C4a基因亚型的传播链同时存在,其中Clade1为优势传播链.
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