【摘 要】
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肺纤维化是一种进展的致死性呼吸系统疾病,预后较差且缺乏特效的治疗方法.研究发现,环状RNA(circular RNA, circRNA)和微小RNA(microRNA,miRNA)作为内源性非编码RNA分子可参
【机 构】
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南华大学公共卫生学院,衡阳421001
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肺纤维化是一种进展的致死性呼吸系统疾病,预后较差且缺乏特效的治疗方法.研究发现,环状RNA(circular RNA, circRNA)和微小RNA(microRNA,miRNA)作为内源性非编码RNA分子可参与多种生物学过程,在肺纤维化的发生发展中起重要作用.本研究利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO).GE02R工具筛选肺纤维化相关的差异表达circRNA及miRNA,使用circular RNA Interactom预测与差异表达circRNA结合的miRNA,用TargetScan,miRDB及miRWalk预测miRNA靶基因,并用DAVID对靶基因进行GO分析和KEGG功能分析,用STRING对靶基因进行蛋白质相互作用预测.结果显示,共筛选出肺纤维化相关的差异表达的circRNA,miRNA分别有18个和21个,预测了与差异表达的circRNA相互作用的miRNA及mRNA,并构建了circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络图.DAVID基因功能富集分析发现,circRNA可能通过AMPK信号通路参与肺纤维化过程.构建蛋白质相互作用网络图发现它的10个关键节点.研究结果旨在为circRNA及miRNA在肺纤维化中的发病机制研究提供参考,为肺纤维化治疗拓宽思路.
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