广东珠海市2007年登革病毒分子流行病学分析

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目的 了解2007年珠海市登革热暴发期间登革I型(ZH1067/07)及Ⅱ型(ZH1340/07)病毒序列特征和可能的传播来源.方法 以GenBank公布的病毒ABI78 040和M29 095为参考,分别设计PCR引物,扩增病毒ZH1067/07和ZH 1340/07全基因组的不同片段并测序,通过末端重叠序列进行拼接组成病毒全基因组序列.序列GenBank登录号分别为Eu359008和Eu359009.参考已公布的登革I/Ⅱ型病毒全基因组序列进行进化分析.结果 拼接后的登革I型病毒基因组全长10 735个核苷酸,经序列进化分析,属登革I型中的第1群(基因I型),与2004年分离自日本的登革I型毒株AB178040及分离自福建的登革I型毒株Fj231/04核苷酸同源性最高,达99%(10 638/ 10735),经流行病学证据支持福建输入病例导致珠海本地暴发;拼接后的登革Ⅱ型病毒基因组全长10 723个核苜酸,经序列的进化分析,属登革Ⅱ型病毒中的第4群(基因Ⅳ型),与2005年分离自文莱的登革Ⅱ型EU179 857和EU179858两毒株距离最近,核酸同源性99%,(10 609/10 705).流行病学调查证明2例均为澳门输入病例.结论 2007年珠海登革I型病毒ZH1 067/07可能来源于福建登革I型毒株Fj231/04,与来源于密克罗尼西亚的AB178 040有很近的亲缘关系;珠海登革Ⅱ型病毒ZH 1340/07可能由澳门输入,与文莱EU179 857有很近的亲缘关系,未导致珠海本地暴发.
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