Angiomotin(AMOT)基因在家犬高原适应性中的研究

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家犬是人类最亲密的伙伴,在人类文明的发展历程中扮演了重要角色。生活于我国青藏高原的藏獒是一种体型巨大的古老犬种。和其它家犬一样,藏獒是由灰狼驯化而来。高原气候有着强紫外照射,干燥寒冷,低压缺氧等特征,藏獒在长期的青藏高原极端气候环境中表现出了很好的高原适应性。由于人类和家犬长期以来的紧密联系,开展家犬高原适应性的研究将对探究人和动物的高原适应性分子遗传机制提供重要的启发和思路,同时也对研究高原低压缺氧导致的一些高原疾病提供一定的临床指导依据。  在开展本论文研究之前,我们对高原家犬进行了全基因组的扫描。结合相关文献的研究报告,我们从筛选出的候选基因中选取了血管抑素受体蛋白(AMOT)基因做为本论文的研究对象。通过对该基因的研究,可以让我们从血管系统发育与成熟的角度理解高原适应性,为以后的相关研究提供新的思路和启发。  AMOT基因其表达产物是血管内皮细胞表面的一个受体蛋白,在血管形成与成熟的过程中起到了重要的调节作用。我们结合全基因组扫描给予的提示,在AMOT基因内含子和基因上游侧翼区各选取了一个片段(B和F)展开家犬高原适应性的研究。  在对这两个片段在11个家犬群体中的DNA测序和分析后,我们检查到了正选择作用在该基因中留下的一些自然选择痕迹。在对B,F两个片段内的SNP位点进行相关遗传多样性与中性进化的检验时,我们观察到在F片段中青海玉树群体的TajimaD值为负值且显著(P<0.01),该结果提示该基因可能受到了正选择作用的影响。为了确定这种结果是否受到家犬群体历史的影响,我们对F片段内的SNP位点做了单倍型频率与海拔关联性的分析。在加入与去除青海极端群体的情况下,都观察到了单倍型频率与海拔高度的显著线性关系(P<0.01,P<0.05)。除了,在F片段中我们观察到这种线性关联外,在对B片段内的分析中我们也得到了显著的线性关系(P<0.01,P<0.05)。通过对两个片段内单倍型频率与海拔的关联性分析,我们推测在F片段中青海群体的TajimaD值可能不是由于群体历史事件而导致。这一结果进一步提示我们AMOT基因可能在家犬高原适应过程中受到了正选择作用。  虽然本研究中所选片段均为非编码区片段,但通过对这两个片段的群体遗传分析我们检测到了该基因受到的正选择信号,这种信号可能是由于搭乘效应所致。然而,结果提示我们,生活于青藏高原的藏獒在面对极端的低压缺氧环境时,可能通过血管系统的发育与成熟相关生理功能的改变以适应高原环境。在以后对AMOT基因高原适应性的研究中,可以本论文的结果为线索选取更多的片段,加入其它地区的家犬群体来寻找到真正受正选择作用的功能位点,为从血管发育与成熟的角度来理解高原适应提供更强有力的支持。
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