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编码基因的转录后调控机制的研究是系统生物学的一个挑战。其中一个热点是越来越多的研究证实具有转录后调控作用的miRNA可以调控很多基因的翻译过程。同时很多miRNA功能的研究的结果显示，miRNA的功能主要是通过调节其靶基因参与的功能而实现的。因此，从全局性的视角来研究miRNAs和其对子通路的调控影响是一个重要的课题。 在本论文的研究中，我们将miRNA靶基因进行子通路的富集分析计算，如果miRNA靶基因显著富集到某个子通路中(P<0.001)，那么这个miRNA和其调控的子通路的关系便建立起来，利用这种方式我们构建了miRNA-子通路网络。通过分析miRNA-子通路网络节点的拓扑特性，我们发现疾病miRNA较非疾病miRNA来说调控更多的子通路。基于miRNA-子通路网络，我们衍生了两个生物相关的网络即miRNA-miRNA网络和子通路一子通路网络。在这两个衍生的网络中，我们发现这两个真是网络较随机网络连接更加紧密，同时找到了一些具备协同调控功能的miRNA模块。此外，我们也构建了疾病miRNA-子通路网络并对网络进行了拓扑性质的分析。对于miRNA而言，我们发现其调控的子通路数量和其关联的疾病数量明显的相关趋势。因此，miRNA-子通路网络不仅可以从全局的视角研究疾病、miRNA和子通路之间的关系.而且也有助于我们从miRNA功能的角度来探索复杂疾病发生和发展的生物学机理。