BMP4,TGFβ-3,FOXE1,MTHFR多态性与广东地区非综合征型唇腭裂关系的研究

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pipiyouxi
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研究背景:  先天性唇腭裂是一种临床常见的出生缺陷,世界范围内统计的发病率约为1.7/1000,拉丁美洲国家和亚洲国家的发病率高而非洲南部,欧洲中部及以色列国家的发病率较低。中国的发病率约为1.82/1000。这种缺陷对患者造成巨大的心理伤害,同时给家庭和社会带来沉重的经济负担,其治疗需要一系列科室的合作如口腔颌面外科、耳鼻喉科、听力、心理学等等,根据伴或不伴身体其他先天畸形,先天性唇腭裂常分为综合征型唇腭裂(SCL/P)和非综合征型唇腭裂(NSCL/P)两种,NSCL/P占先天性唇腭裂的约70%。  NSCL/P的发病机制很复杂,遗传学方面的研究已经证实 MTHFR、TGFβ-3、BMP4、TTF2/FOXE1在多个人群中与 NSCL/P的发生有相关性,然而不同人群的结论并不完全统一,反映了NSCL/P的遗传异质性,广东地区尚未见上述四个基因的相关报道。  研究目的:  探讨BMP4(rs762642、rs17563、rs10130587)、FOXE1(rs1443434、rs4460498)、MTHFR(rs1801133、rs1801131)、TGFβ-3(rs226862、rs3917168、rs3917169)共计10个SNP位点与广东地区非综合征唇腭裂的之间的关系。  研究对象:  1.健康人:本研究共收集52例无血缘关系的广东籍贯汉族健康人血液样本,来自于就诊广州市妇女儿童医疗中心,具体纳入标准是:  (l)所有研究对象均为中国广东籍贯汉族人群;  (2)家族中均无唇腭裂患者;  (3)无其它先天性疾病或先天畸形,无重要脏器疾病。  2.非综合征唇腭裂患者:165例病例样本来自2009年1月—2012年10月就诊于广州市妇女儿童医疗中心口腔颌面外科的手术患者,分为三组,其中CPO53例,CLO52例,CLP60例。具体纳入标准是:  (l)所有研究对象均为中国广东籍贯汉族人群;(2)确诊为非综合征型唇腭裂患者。  研究方法  全血DNA试剂盒提取基因组DNA后,采用目的片段扩增采用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术,基因型分型采用直接测序法,统计分析采用 Hard-Weinberg Equilibrium平衡分析(H-W平衡)、病例-对照比较(Case-Control Comparisons)、Fisher精确检验法、优势比(odd ratio,OR)和95%可信区间(95% CI)。  研究结果  (1)CPO组中 BMP4 rs762642(p=0.003)、TGFβ-3 rs3917168(p=0.014),rs3917169(p=0.014)具有统计学意义,MTHFR2个SNP位点,FOXE13个SNP位点(p>0.05)无统计学意义  (2)CLO组中BMP4 rs762642(p=0.02)、rs17563(p=0.003)、rs10130587(p=0.007)、rs35107139(p=0.007)具有统计学意义,MTHFR2个 SNP位点、FOXE13个 SNP位点、TGFβ-33个SNP位点(p>0.05)无统计学意义;  (3)CLP组中BMP4 rs762642(p=0.031)、rs10130587(p=0.023)、rs35107139(p=0.023)具有统计学意义,MTHFR2个SNP位点、FOXE13个SNP位点、TGFβ-33个SNP位点(p>0.05)无统计学意义;  结论:  在本次研究的中国广东地区人群中,我们发现BMP4与NSCL/P的发生相关,TGFβ-3与CPO的发生相关。  (1)BMP4 SNPs rs762642的G等位基因、TGFβ-3 SNPs rs3917168的T等位基因、rs3917169A等位基因与单纯性腭裂有相关性。  (2)BMP4 SNPs rs17563的C等位基因、rs762642的G等位基因、rs10130587、rs35107139的G等位基因与单纯性唇裂有相关性。  (3)BMP4 SNPs rs17563与单纯性腭裂及唇腭裂无相关性。  (4)FOXE1 SNPs rs1443434、rs1443435、rs4460498与单纯性腭裂、单纯性唇裂及唇腭裂无相关性。  (5)MTHFR SNPs rs1801133、rs1801131与单纯性腭裂、单纯性唇裂及唇腭裂无相关性。  (6)TGFβ-3 SNPs rs226862与单纯性腭裂、单纯性唇裂及唇腭裂无相关性。
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