奶牛乳腺炎相关lncRNA的鉴定和功能验证

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奶牛乳腺炎通常由致病菌侵入奶牛乳腺后并在乳房增殖引起的一种疾病,是奶牛养殖业最流行的疾病之一,给全球造成了巨大的经济损失。而环境中的大肠杆菌和金黄色葡萄球菌被认为是奶牛乳腺炎的主要致病菌。大肠杆菌的主要结构元件脂多糖(lipopolysaccharide , LPS)和金黄色葡萄球菌胞壁成分脂磷壁酸(lipoteichoic acid,LTA)可通过结合Toll样受体引起NF-κB转录因子复合体的激活参与炎症反应过程。越来越多的研究表明长非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)也在炎症反应中发挥着重要的作用,然而参与牛乳腺炎中lncRNA及其功能仍然未知。  本实验中使用热灭活的细菌处理奶牛乳腺上皮细MAC-T细胞,以肿瘤坏死因子-α明显上调作为炎性应答指标,建立乳腺炎细胞模型,并通过高通量测序分析获得了正常MAC-T细胞和乳腺炎模型细胞的lncRNA表达谱,然后运用生物信息学方法筛选出差异表达的lncRNA,最后结合CRISPR-Cas9系统进一步研究特定候选 lncRNA 的功能。测序结果中共鉴定出 1323 个新的 lncRNA, 其中 53个为差异表达的lncRNA。而lncRNA的功能预测表明差异表达的lncRNA与细胞免疫密切相关。对新发现的被命名为lncRNA-TUB的lncRNA进行深入功能研究 发 现 , 敲 除 lncRNA-TUB 后 , 乳 腺 上 皮 细 胞 发 生 了 明 显 的EMT(Epithelial-Mesenchymal Transition)现象,同时影响上皮细胞增殖、迁移、酪蛋白分泌等生理过程,并参与乳腺上皮细胞的炎症应答过程。  综上所述,实验结果表明本研究筛选出的差异表达的lncRNA与奶牛乳腺炎紧密相关,而 lncRNA-TUB 在包括炎症应答在内的很多重要的生理和病理过程中发挥着重要的作用。本研究初步探索了 lncRNAs 与奶牛乳腺炎之间的相互联系,为奶牛乳腺炎的病理机制的研究提供了新的思路。
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