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本研究测定了羊肚菌科羊肚菌属6种20株的ITS序列。并在GeneBank中搜索下载了相关属[钟菌属(Verpa),皱盘菌属(Disciotis)]的ITS序列作为外类群。对本实验测定的序列及外类群的ITS序列,采用最大简约法(maximumparsimonymethod,MP)和邻接法(neighbor-joiningmethod,M)进行分析,并构建分子系统树,探讨羊肚菌属及其相关属的系统发育关系。结果表明,针对ITS序列分析可以将羊肚菌属各种分为两个大的分支,包括黑羊肚菌和黄羊肚菌(DanielWipf,AnneFribourg1999)。黑羊肚菌包括M.angusticeps、M.costata、M.elata、M.conica,黄羊肚菌包括M.esculenta、M.crassipes,上述分支结果与三集合种(speciesaggregate)概念在形态上也是吻合的。在黑羊肚菌分支里,M.conica可以明显地与其他种区分开来,其他各种间的区别也是可见的。与此同时我们发现不同地域的同一种羊肚菌间或多或少的也存在着遗传和系统发育距离,这也验证了不同生态环境对羊肚菌系统发育的影响。本课题研究结果为羊肚菌属的系统分类研究提供了较为明确可靠的分子性状依据。