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目的: 苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU;OMIM 261600)是最常见的氨基酸代谢病之一,呈常染色体隐性遗传疾病,世界各地都在研究PAH基因突变特点,以明确PKU患者人群分布特征和地区分布特征,为PKU的诊断和治疗提供帮助。因此,本研究应用DNA直接测序的方法对PAH基因进行突变分析,以了解广州地区PAH基因突变类型及突变热点,有助于PKU患者的早期诊断和治疗,为遗传咨询和产前诊断提供有力的理论依据,进一步丰富中国人群PAH基因突变谱。 研究对象与方法: 1.研究对象: 选取2009年1月至2013年3月期间就诊或转诊广州市妇女儿童医疗中心新生儿筛查中心,Phe筛查阳性病例61例。61例患儿中,对其中2例行家系分析。 2.方法: 1)实验方法在UCSC数据库中提取基因组DNA序列,对PAH基因编码的13个外显子及外显子-内含子交界区设计相应引物,并进行PCR扩增,然后运用DNA测序技术对PAH基因作序列分析。 2)序列分析采用Chromas软件作序列分析,Clustalx软件作序列比对,参考PAHlocus数据库(http://www.pahdb.mcgil1.ca)命名和定义新突变。 3)统计分析选择两独立样本的t-test,检验水准a=0.05,用SPSS13.0统计软件进行分析。 结果: 1、PAH基因突变检出率在61例PKU患儿中,总的检出率为89.34％(109/122)。外显子7突变检出率35.8%(39/109)最高,其中突变频率最高的3种突变分别为R243Q9.84%(12/109)、R241C9.02%(11/109)以及EX6-96A>G5.74%(7/109)。新突变的检出率为9.83%(12/122)。 2、突变类型在61例PKU患儿中,共检出53种不同的PAH基因突变,其中,错义突变35种,无义突变6种,剪接突变5种,缺失突变3种,沉默剪接突变1种,插入突变1种,沉默突变1种和缺失/插入1种。 3、检出2个突变等位基因的49例,检出3个突变等位基因的1例,检出1个突变等位基因的8例,未检出突变突变等位基因的3例。 4、新突变国际上首次发现的新突变12种,分别为S446G、F392I、F331S、L293S、H285R、Y154X、Q172H、F161fsX24、A246T、R158G、Y166X和H107R。 5、2个家系结果其中一个家系的风险胎儿(同卵双胞胎)诊断为携带者,遗传来自母亲的PAH基因突变;另一个家系父母均为PAH基因突变携带者,先证者和胎儿经测序检测均为PKU患者,突变分别来自父亲和母的PAH基因突变。 结论: 1、获得了广州地区PAH基因突变谱,其中R243Q、R241C、EX6-96A>G为高频突变,突变检出率分别为9.84%、9.02%和5.74%。 2、外显子7上PAH基因突变频率最高。 3、发现12种中国人群PAH基因新突变,进一步丰富了中国人群PAH基因突变谱。 4、在临床产前筛查中应建立一套PKU筛查策略。