用微卫星标记构建水稻日本晴与广陆矮4号杂交F群体的遗传图谱

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用分子标记构建水稻遗传图谱得到了快速的发展,自从McCouch等在1988年构建的第一张图谱开始,到现在已经有很多用不同的作图群体和分子标记构建的图谱,而大多数分子标记都是RFLP标记和混合标记,最近随着水稻全序列基因组的完成,用单一的SSR标记构建的遗传图谱越来越多。用各种分子标记分别在多种作物群体中构建遗传图谱,在许多作图中都有偏分离现象存在,其中引起的原因也是多种多样,诸如作图群体、遗传搭车效应、配子体和孢子体选择、非同源重组、基因转移、转座因子和环境因素等等都可能是形成偏分离的原因。F2代群体是常用的作图群体,迄今为止,大多数植物的DNA标记连锁图谱都是用F2群体构建的。不论是自花授粉植物,还是异花授粉作物,建立F2群体都是容易配制,且不需要很长的时间,这是使用F2群体进行遗传作图的最大优点。一些高密度分子连锁图谱的构建,为在整个基因组中调查表现偏分离的位点提供了可能。本研究选用全基因组测序已经完成的材料粳稻日本晴和完成了第4染色体全序列测序的籼稻广陆矮4号进行杂交,共90个单株,构建了一个包含148个微卫星标记的水稻分子遗传图谱.分析并讨论了偏分离形成的原因。
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