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合并财务报表是公认的会计难题之一。为了规范企业合并财务报表的编制，中国财政部分别于1995年初和2006年2月发布了《合并会计报表暂行规定》和《企业会计准则第33号一合并财务报表》等文件。学术界对合并财务报表的理论、个别项目编制方法等研究较多，而对实务研究，特别是在会计信息系统中如何实现合并则研究得较少。
现有的合并财务报表信息系统主要局限于以传统方法来编制合并财务报表，即其功能模块主要是模拟手工操作，以个别会计报表和合并工作底稿表为基础。这样开发出来的软件产品只能部分代替手工操作，效率较低，没能充分发挥计算机的自动化处理功能，使用人员对软件的操作也很不方便。
本文在跟踪国内外有关合并财务报表信息系统的研究状况及当前软件实施情况的基础上，分析了当前合并财务报表信息系统研究中存在的问题，包括大多数学者和软件开发商都默认了并表法是编制合并财务报表的唯一方法，或者把研究的重点都放在系统的体系架构和功能的改进上。因此本文力图通过分析和对比手工编制模式、并表法下的电算化编制模式和并账法下的电算化编制模式，进而指出并账法是更易于用计算机实现的合并财务报表编制方法。接着通过具体案例分析对比并表法与并账法下需要编制的抵销分录，证实并账法下需编制的抵销分录将大大减少。最后在这些研究分析的基础上，着手进行并账法下合并财务报表系统的分析建模。文章研究了系统功能建模、系统数据库建模、系统文件结构设计及系统处理流程等，并针对基础数据模块、集团数据库模块、数据处理与控制模块、内部交易抵销模块、信息集成系统模块等主要功能模块的作用、完成的任务进行了深入地研究和详细描述，以指导程序设计人员进行软件开发。
本文研究的理论意义在于详细分析了以并账法为基础的合并财务报表编制的思想方法和具体编制方法，突破了传统的以个别会计报表和工作底稿为基础的合并财务报表方法；同时探讨了并账法下的合并财务报表信息系统的编制模式并构建了相应的系统功能、系统数据库、处理流程等。实际意义在于指导软件开发人员开发出符合企业实际需要的、能快速及时地在事中进行会计报表合并，同时易用、操作方便的合并财务报表信息系统软件产品。