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麻花艽Gentiana straminea Maxim.为龙胆科Gentianaceae龙胆属Gentiana(Toum.)L.多年生草本植物，收录于2015年版《中华人民共和国药典》中，是中药材秦艽和藏药“解吉嘎保”的基原植物之一。近年来，随着市场需求不断增加，秦艽药材已出现供不应求之势。麻花艽多生长于西部地区，生态环境脆弱;加之过度采挖，资源状况不容乐观。麻花艽等4种秦艽基原植物均被列为《国家重点保护野生药材物种名录》之中，对其进行保护更显紧迫。本研究通过对麻花艽的遗传多样性进行分析，以期为该物种的就地保护、探讨环境等因素对于遗传分化的影响及麻花艽药材的道地性研究提供基础资料。具体研究内容如下: 1.通过标本查阅及野外考察，掌握麻花艽Gentiana straminea Maxim.的性状特征，地理分布及生境状况，并进行样品采集。采集青海、甘肃、西藏和四川地区28个麻花艽居群共83份样晶，覆盖本物种主要分布区，并加入直萼龙胆Gentiana erecto-sepala和粗茎秦艽Gentiana crassicaulis各一个居群作为外类群。 2.从加拿大哥伦比亚大学公布的100条ISSR引物(University of BritishColumbia，Set No.801-900)中筛选出7条用于PCR扩增。对反应体系中的DNA模板浓度、Mg2+浓度、引物浓度、dNTPs浓度、Taq聚合酶浓度和退火温度分别进行考察，建立了稳定的合适于麻花艽ISSR-PCR的反应体系。 3.对麻花艽ISSR遗传多样性进行分析，7条引物一共得到95条条带，其中多态位点88个，多态位点百分率(PPL)为92.63％，麻花艽居群间的期望杂合度(He)为0.2882，Shannons多样性信息指数(I)为0.4371，麻花艽种群遗传多样性水平较高。种群间基因分化系数(Gst)为0.6783，基因流(Nm)为0.2371，遗传距离为0.0743～0.4900，其中SC3（四川）与GS7（甘肃）之间的遗传距离最大，SC5（四川）和SC6（四川）之间最近，居群间遗传多样性水平高于居群内。对所有样品进行聚类分析，结果显示，麻花艽遗传特性与地理分布具有一定相关性。 4.基于课题组前期获得的麻花艽叶绿体全基因组序列，从7个SSR中筛选出1个具一定鉴定意义的分子标记，即位于sbM-trnD-GUC间隔区的(T14)单核苷酸SSR具有居群间差异。通过对所有样品进行扩增及测序，初步探讨了该SSR在居群间的分布规律。