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囊瓣芹属Pternopetalum Franchet是伞形科Apiaceae/Umbelliferae芹亚科Apioideae芹族Apieae重要成员，分布于南朝鲜、日本、中国西南部和邻近的喜马拉雅地区，横断山区是其多样性中心。
基于19个标本馆标本材料、野外调查以及相应的实验证据，本博士论文从三个方面对囊瓣芹属展开了全面而系统的研究。一是通过标本观察和野外调查，利用标本管理系统BRAHMS和表型分析软件包DELTA系统，完成了囊瓣芹属的世界性分类修订：二是基于上述的分类方案，选择伞形科其它属的44个种作为参考性类群(Reference taxa)，利用Winclada，NONA和MESQUITE软件包开展了分支系统学研究；三是基于坐标化的点分布数据，利用DIVA-GIS系统的生态位模型，进行潜在分布预测和生态地理分布特征的分析。研究的初步结论如下：
一、分类修订
根据对19个标本馆标本(包括85个模式采集)的考证，以及对云南、四川、贵州等地野外居群的观察，结合DELTA系统的表型分析，本研究确认囊瓣芹属包含14个种，提出了14个新异名，属下分为东亚囊瓣芹组Sect.I.PteridophyllaeH.Wolff和囊瓣芹组Sect.Ⅱ.Pternopetalum H.Wolff两个组的分类方案。前者包括东亚囊瓣芹P.tanakae(Sav.&Franchet)Hand.-Mazz.、高山囊瓣芹P.subaloinumHand.-Mazz.、洱源囊瓣芹P.molle(Franchet)Hand-Mazz.等5个种；后者包括五匹青P.vulgare(Dunn)Hand.-Mazz.、囊瓣芹P.davidii Franchet和澜沧囊瓣芹P。delavayi(Franchet)Hand.-Mazz.等9个种。萼齿、花柱基、和花柱的形态是区别两个组比较好的形态学特征。叶的着生位置、最终末回裂片的形状(是否异形)、分裂回数以及伞形花序着生的位置和果棱表面的附属构造是种间识别有用的检索特征。
二、系统发育分析
根据如上的14个种的分类方案，另外选取了伞形科小芹属Sinocarum H。Wolff、丝瓣芹属Acronema Falc.ex Edgew.和鸭儿芹属Cryptotaenia L.等10个属共44种作为参考类群，基于63个广义形态学性状和58个种的形态学矩阵，利用最大简约法对囊瓣芹属进行了分支分析。结果表明，囊瓣芹属的14个种与日本特有单型的仙洞草Chamaele decumbens(Thunb.)Makino.形成一支，处于分支图的基部位置。表明囊瓣芹属与鸭儿芹属有较近的亲缘关系。囊瓣芹属可能是单系内群，但它与Chamaele Miq.属间关系需要进一步研究。属下形成以五匹青P。vulgare和东亚囊瓣芹P.tanakae为代表的两个主干演化线。分支进化(Cladogenesis)在两个主干演化线形成了形态和地理上对称分布的“种对”。根据形态特征的变异和地理分布，这些“种对”分为三种类型：1、形态上多变而地理上广布的类型，以东亚囊瓣芹P.tanakae和五匹青P.vulgare为代表；2、形态上稳定地理上狭域特有的类型，以薄叶囊瓣芹P.leptophyllum(Dunn)Hand.-Mazz.和川鄂囊瓣芹P.rosthornii(Diels)Hand-Mazz.为代表；3、形态上趋同而多变，地理分布上几乎完全重叠的类型，以洱源囊瓣芹P.molle和澜沧囊瓣芹P.delavayi为代表。
性状状态的分析显示，囊瓣芹属形态特征演化具有较强的同塑性。不等长的伞辐和花梗，以及囊状的花瓣基部三个形态学特征可以标识包括仙洞草在内的囊瓣芹分支。祖征状态的重建表明，东亚囊瓣芹分支相对保留了更多的祖征，是属内相对原始的类型；五匹青分支是后期生境需求的特化，适应潮湿和荫蔽环境的衍生类型。
三、生态地理分布
基于1128个坐标化的点分布数据和生态位模型，利用地理信息系统软件包DIVA-GIS对囊瓣芹属的物种多样性、现代地理分布、潜在分布进行了分析。结果表明，二郎山-峨眉山地区以及重庆金佛山及其临近地区是囊瓣芹属的两个主要的多样性中心。分布区内局部尺度上的异常性多样性(Diversity abnormalies)可能有两个来源：一是高的异质性生境条件下物种形成速率的差异；二是中国西南山地的“冰原岛峰效应”(Nunataks)，比如峨眉山和金佛山，对属的早期演化线成员所起到的“避难所”(Refuge)的作用。
所预测的潜在分布范围与观察到的地理分布范围是一致的，说明对特化的气候忍耐性是限制囊瓣芹属物种地理分布的主要因素。温度和降水的季节性变化对囊瓣芹属代表中的地理分布限制作用比较大。亚热带-高山针阔常绿林是属下物种比较适宜的生境。属的地理分布可能形成于中新世以后，生态位的保守性是解释囊瓣芹属东亚本土就地分化和多样化的原因。属的分布范围的形成可能经历了一个早期南退西进的过程，后期分布范围变化可能主要是东西方向上的迁移和扩展。喜马拉雅-横断山-峨眉山/金佛山/神农架-日本、南朝鲜一线是囊瓣芹属多样化过程中分布范围东西延伸的重要通道。喜马拉雅-中国西南-日本朝鲜亚热带森林植被的完整性和连续性是囊瓣芹属演化和分布区形成的基本条件。