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目的:预测miR-lOa*在柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus B3,CVB3)基因组中靶序列;定点诱变CVB3基因组上miR-10a*可能的靶序列,构建CVB3突变株,为后续靶点确定打下基础。
方法:利用RNAHybrid 2.2软件预测CVB3基因组中miR-10a*可能的靶序列,通过Overlap PCR将可能的靶点进行定点诱变,构建含有突变靶点的CVB3病毒质粒。将质粒转染HeLa细胞恢复突变毒株,空斑试验纯化病毒和测定突变病毒株的毒力。
结果:通过RNAHybrid 2.2预测并初步筛选出5个miR-10a*在CVB3基因组中可能的作用靶点。定点诱变上述预测靶序列,成功构建了5株含有突变靶点的病毒质粒;将突变病毒质粒转染HeLa细胞,mt-454、mt-4343和mt-6918转染后均可见细胞变圆、固缩、折光性增强等明显的细胞病变现象,mt-334和mt-4945未见明显的细胞病变特征;空斑形成试验测定突变病毒株的毒力,mt-454的毒力为4x106pfu/mL,mt-4343的毒力为3.3x105pfu/mL,mt-6918毒力为3x106pfu/mL。
结论:成功构建了5个含有miR-10a*突变靶点的CVB3病毒质粒,但mt-334和mt-4945转染HeLa细胞后未能生成病毒,为致死性突变;虽然mt-454、mt-4343和mt-6918的毒力较原病毒弱,但均可用于下一步靶序列的确定。