核酸适体分离细菌内毒素的研究

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核酸适体是一类寡核苷酸,其对不同的靶标有着特异且高效的亲和力,可以结合不同的目标。本论文筛选了一种针对细菌内毒素的核酸适体,并开展了将其应用于内毒素分离的研究。  基于SELEX(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment)筛选技术,经过15轮正筛和5轮反筛,共得到13个克隆子,测序,获得1条高频序列,命名为 EAQ3。通过DNAMAN6.0.3.99软件对13条序列进行一级结构和二级结构分析,结果表明,一级结构分析表明这13条序列的一致性为75.15%,其中:随机序列区域中大多数富含G、C碱基;有25条序列的随机序列区域以T,G结尾。所以很有可能随机序列区域中的G、C碱基和T、G尾巴与靶标的结合有关。二级结构分析表明所有13条序列都形成茎环结构,其中EAQ3有可能形成G-四聚体结构。  对三条序列EAQ1,EAQ2,EAQ3与内毒素结合的亲和性和特异性测定。检测结果表明,EAQ3与内毒素结合的亲和性最高,特异性最好。以EAQ3制备核酸适体-磁珠分离细菌内毒素。经过吸附动力学曲线拟合,该核酸适体-磁珠在10分钟内对内毒素的吸附量最高达到1199 EU/g,吸附过程快速,本课题开发的核酸适体-磁珠将可应用于生物制品中内毒素的去除。
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