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普通野生稻是国家宝贵的种质资源，是饲料水稻育种的重要物质基础。普通野生稻具有分蘖能力强、生长速度快、根系发达、再生能力强、抗逆性强等多种栽培稻不具有或已消失的优良特性。为此，本研究利用广东高州普通野生稻GZW135与栽培稻台中65进行杂交，构建普通野生稻与栽培稻杂种F2群体，利用作图软件Mapmaker/EXP version3.0构建遗传连锁图谱，然后用Mapmaker/QTL1.0软件对早期分蘖、成熟分蘖、自然高度、绝对高度、鲜重、干重、再生分蘖、再生株高、再生干重等农艺性状以及粗蛋白含量、粗纤维含量、粗脂肪含量、粗灰分含量、可溶性糖含量、硅酸含量等营养含量进行QTL定位分析。最后用Mapchart version2.2软件绘制连锁遗传图谱。主要研究结果如下：
⑴广东高州普通野生稻GZW135与栽培稻台中65亲本及其杂种F2群体的农艺性状和营养含量的调查、分析表明：在被调查的F2代农艺性状和营养含量中，绝大多数性状都基本符合单峰正态分布特征，而且这些性状表现大多数在两亲本之间分布，少数高于高亲或低于低亲，满足基因定位的要求。在分蘖、自然高度、绝对高度、鲜重、干重、粗蛋白含量、粗纤维含量方面，普通野生稻GZW135高于栽培稻台中65；而在粗脂肪含量、粗灰分含量、可溶性糖含量、硅酸含量方面，普通野生稻GZW135低于栽培稻台中65。
⑵随机均匀选取分布在水稻12条染色体上的174对引物，标记间平均选择距离为10cM，对亲本普通野生稻GZW135和栽培稻台中65进行多态性检测，共筛选出在两亲本之间具有多态性的引物85对，平均多态率为48.85％，它们较均匀分布在水稻12条染色体上。
⑶利用Mapmaker/EXP version3.0和Mapmaker/QTL1.0软件对广东高州普通野生稻GZW135与栽培稻台中65杂种F2群体的农艺性状、营养含量与SSR标记进行连锁分析。对早期分蘖、成熟分蘖、自然株高、绝对株高、鲜重、干重、再生分蘖、再生株高和再生干重等农艺性状以及粗蛋白、粗纤维、粗脂肪、粗灰分、可溶性糖、硅酸等营养含量进行QTL定位，共检测到35个QTLs，它们分布在水稻12条染色体上，平均每条染色体检测到2.9个QTLs，最少检测到1个，最多检测到5个。在35个QTLs中，15个为主效QTLs(贡献率大于15％)。平均每个性状检测到2.3个QTLs，最多检测到6个，最少检测到0个。最大贡献率QTL为56.8％，最小贡献率QTL为7.9％。其中早期分蘖检测到2个QTLs，成熟分蘖检测到2个QTLs、自然株高检测到6个QTLs，绝对株高检测到2个QTLs，鲜重检测到3个QTLs，干重检测到5个QTLs，再生分蘖检测到3个QTLs，再生株高检测到1个QTL，再生干重检测到2个QTLs，粗蛋白检测到3个QTLs，粗脂肪检测到1个QTL，可溶性糖检测到3个QTLs，硅酸检测到2个QTLs，粗纤维和粗灰分没有检测到QTL。