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目的：通过对新疆某三甲医院2006～2011年运行效果进行单层次和综合评价和分析，从而掌握医院的总体运行状况及其运行变化发展趋势，探寻影响医院运行效果的因素，分析其形成原因，并提出建设性的对策，为促进医院可持续发展提供科学依据。 方法：采用文献资料分析优选法选取医院统计报表中代表性好、敏感性高的指标作为医院运行效果的评价指标。通过应用构成比、平均增长率和主成分分析法，使用EXCEL2003和SPSS15.0软件，对新疆某三甲医院的工作效率、工作质量、经济运行指标等基础数据进行综合统计分析。 结果：从总体上看医院的运行效果逐年好转。医院的业务收入2006～2011年成递增趋势，2011年最高3.94亿元，环比增长率2009年最高59.69％；专业技术人员所占比重增长明显,2011年最高87.4%；门诊诊次，出入院病人大幅度增加，增长率远超病床的增长速率；患者满意率以2008年最高96.8%，2010年最低95.2%，2011年有所提升；平均住院日总体有下降趋势，平均增长速度为-0.15%；病床使用率与病床周转次数变化趋势相同,06到09年增长明显,但在2010有所下降；入出院诊断符合率总体还是保持在一个相对较高的水平，>91%；平均开放床位数逐年增加；治愈率较低，2011年最低35.1%；危重病人抢救成功率总体成递增趋势，但是还是处在较低的水平，2010年最高81.3%；无菌手术甲级愈合率一直保持在98%以上；病死率平均增长速度为-4.64%；经济运行指标均成稳步提高趋势，其中药品收入占业务收入的比重有所下降，平均增长速度为-0.97%。从综合评价来看2006年～2011年的综合得分呈现递增趋势。2006年医疗质量运行效果相对较低综合主成分F值为-32.9，2011年综合评价得分最高F值为24.25。 结论：医院现况及单层次指标的分析，有助于我们全面系统的掌握医院的运行情况；综合评价的变化趋势与医院采取各项管理措施是相一致的；对医院的运行效果进行分析，有利于掌握医院的发展变化趋势；利用主成分分析法评价可以客观的评价医院的总体运行效果的变化趋势。