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目的:通过检测载脂蛋白D(apolipoprotein D,APOD)基因单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms,SNP)位点,探讨其与中国北方汉族人群散发性阿尔茨海默病(sporadic Alzheimers disease,SAD)的相关性。
材料与方法:根据NINCDS-ADRDA标准,收集了256例SAD患者,以294例正常人作为对照,随机选取SAD15例及正常对照者15例,采用PCR结合直接测序的方法,筛查APOD基因所有外显子及其两端内含子多态性位点。选取等位基因频率大于10%的位点,利用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术,对所有受试者进行APOD多态位点分型,采用病例—对照相关性研究方法,研究其与SAD发病的关系。同时对各位点间的连锁不平衡及构建的单体型进行疾病相关性分析。
结果:
(1)APOD第2外显子存在T/C多态性(rs5952),第3外显子下游+45(即第3内含子,rs1568566)存在C/T多态性。2例SAD各发现1个变异位点,分别为1号内含子74位碱基G→C及5号外显子302位碱基C→G,在SNP数据库上检索未发现这两个变异位点,为新的突变。
(2)APOD rs5952 T/C等位基因频率和基因型频率在SAD组和对照组间的分布有统计学差别(等位基因:P=0.013;基因型:P=0.036)。其中SAD组携带C等位基因(CC和CT基因型)频率高于对照组(73.4%vs63.9%,P=0.017),Logistic回归分析校正年龄、性别和是否携带APOEε4等位基因因素的影响后,携带C等位基因增加了SAD发病风险(校正后OR=1.817,95%CI=1.237~2.669,P=0.002)。分别按照有无携带APOEε4等位基因、性别及年龄(65岁为界)分层分析后,发现APOD rs5952多态性与SAD之间的关联见于未携带APOEε4等位基因者、男性或早发AD(≤65岁,early onsetAD,EOAD),提示APOD rs5952多态性与APOE基因、性别及发病年龄可能存在着交互作用。进一步Logistic回归分析证实性别以及发病年龄(≤65岁)分别和APOD基因rs5952多态性存在交互作用(P=0.002;P=0.002),说明男性协同APOD rs5952C等位基因增加了SAD发病风险,携带APOD rs5952C等位基因增加EOAD的发病风险。
(3)APOD rs1568566 C/T等位基因频率和基因型频率在SAD组和对照组间的分布有统计学差别(等位基因:P=0.013;基因型:P=0.039)。其中SAD组携带T等位基因频率(TT和TC基因型)高于对照结果(77.0%vs67.7%,P=0.016),Logistic回归分析校正年龄、性别和APOEε4+等位基因因素的影响后,携带T等位基因使SAD发病风险增加近1.6倍(校正后OR=1.563,95%CI=1.060~2.306,P=0.024)。按照是否携带APOEε4等位基因、性别以及年龄(65岁为界)进行分层分析,发现携带rs1568566T等位基因与SAD之间的关联分别见于未携带APOEε4等位基因者、女性或晚发AD(>65岁,late onset AD,LOAD),提示APOD rs1568566多态性与APOE基因、性别及发病年龄可能存在着交互作用。进一步经Logistic回归分析证实女性及发病年龄(>65岁)分别和APOD基因rs1568566多态性存在交互作用(P=0.002;P=0.005),说明女性协同APODrs1568566T等位基因增加了SAD发病风险,携带APOD rs1568566T等位基因增加LOAD的发病风险。
(4)APOD基因rs5952位点与rs1568566位点在北方汉族人群中存在连锁不平衡(D=0.540,r2=0.197)。其中SAD组携带rs5952T-rs1568566C单体型的频率显著低于正常对照结果(12.2%vs24.7%,x2=28.219,P=0.000),携带T-C单体型可使SAD的发病风险降低近60%(OR=0.421,95%CI=0.305~0.583,P=0.000)。
结论:
(1)北方汉族人APOD基因存在2号外显子rs5952和3号内含子rs1568566两个多态位点。
(2)APOD基因2号外显子rs5952C等位基因、3号内含子rs1568566T等位基因均可增加SAD发病风险。携带rs5952C等位基因与男性可协同增加SAD发病风险,携带rs1568566T等位基因与女性可协同增加SAD发病风险。
(3)APOD基因2号外显子rs5952和3号内含子rs1568566两个多态位点在北方汉族人群中呈现连锁不平衡。携带rs5952T-rs1568566C单体型可能对SAD的发病有一定的保护作用。