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随着我国经济的迅速发展，各级政府的职能迅速扩大，公共支出剧增，为了审查政府部门经济活动的效果、效率，绩效审计应运而生。政府绩效审计是对政府部门经济活动就其实现经济性、效率性和效果性的程度进行独立的评价，提出改进意见，从而改善公共责任，为有关方面的决策提供信息的一种审计类型。在现代审计类型正面临着如何从以传统的财务收支审计为主转变为以绩效审计为主的今天，政府绩效审计已成为一个充满活力的新兴课题。
自2002年以来，深圳市政府绩效审计经历了从推开绩效审计之门的创新阶段到探索绩效审计实现模式的实践阶段的发展过程。深圳市政府绩效审计有着巨大的影响，审计得出的结果有着较高的社会关注度。在深圳乃至全国都曾掀起过“审计风暴”。例如，2002年，深圳市审计局首次对12家市属医院医疗设备采购及大型医疗设备的使用和管理情况进行绩效审计，此举在全国引起了强烈的反响。深圳绩效审计正蓬勃发展，取得可喜的成绩，但同时我们也要清醒的看到，虽然深圳是全国政府绩效审计的先行者，但仍然存在着诸多的不足。总结深圳市政府绩效审计的经验，剖析其存在的不足，为政府绩效审计的未来发展奠定良好的基础，已成为深圳市政府和学术研究领域的重要研究课题。正是在这种背景下，本文选择以深圳市政府绩效审计作为研究对象，分析政府绩效审计的意义和重要性，梳理深圳市政府绩效审计的发展现状，透视政府绩效审计存在的问题，并且为改善政府绩效审计提出思路和对策。
本文研究的方法包括：文献资料的阅读与研究、案例研究与分析、对具体审计工作人员进行访谈并组织座谈等。即在阅读现有绩效审计的基础上，理解当前国内外政府绩效审计的研究现状和发展不足，通过对深圳政府绩效审计案例的分析，透视政府绩效审计当前存在的问题；通过对审计工作人员的访谈和座谈，理解审计队伍的思想状况和认识态度。
论文包括如下几大部分：导论部分论述了选题原因、研究意义、研究现状和研究方法等问题，为论文的写作奠定良好的基础。第一章分析了政府绩效审计兴起的背景、发展现状和现实意义，为论述深圳市的政府绩效审计提供专业的背景。第二章廓清了深圳市政府绩效审计的发展历程，表明了深圳政府绩效审计的特色和成就。第三章集中分析了深圳市政府绩效审计存在的不足，如认识不到位、审计能力低、审计基础有缺陷、制度建设事后等问题，有助于我们认识到开展良好的政府绩效审计所必须具备的基础和条件。第四章在分析问题的基础上，提出了改善深圳市政府绩效审计的对策。