论文部分内容阅读
本文对绿豆Ty1/copia反转录转座子的分离与分析及其在嫁接变异中的可能作用进行了探讨。本研究构建了绿豆基因组文库,并从该文库中筛选得到了两条全长的Ty1/copria反转录转座子序列。分析表明,上述两个转座子属于一个家族,在绿豆基因组中的拷贝数约为240。序列和结构的分析还表明,尽管这两个转座子内含终止密码子,但其结构完整,具备所有该类转座子的特征序列,并且从其序列可以得到推定的如下顺序的编码蛋白:5,-Gag-protease-integrase-reverse transcriptase-RNase H-3’。将这两个转座子的蛋白酶、整合酶、反转录酶和RNA酶H的氨基酸序列与来自其它物种的同类序列以及几类主要的反转录因子的相关序列进行了多序列比对,发现了这些酶中的保守位点和本家族转座子的进化位置。