云南省鸡油菌复合种的遗传多样性和线粒体重组分析

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鸡油菌属(Cantharellus Fr.)(俗名:杏黄菌、鸡油菌)是一类形态特殊、味道鲜软的野生食用菌。在我国西南地区尤其是云南地区分布广泛,且它们具有极高经济价值。在北美、西欧的贸易商人认为“在众多珍稀野生食用菌中,鸡油菌是最受消费者欢迎的”。在2006年,洛杉矶市中心农产品批发市场上鸡油菌的价格卖到将近20美元/磅。近年来关于鸡油菌属分类和分子系统学的研究逐渐成为热点,然而对于单个物种的群体遗传方面涉及的较少。  本研究采用多基因联合分析的方法,对云南省鸡油菌类群的群体遗传结构,生殖策略,云南鸡油菌的系统分类和隐存种分化,及其核基因与线粒体基因的变异情况作了初步研究。旨在从分子角度更好的探讨云南省区域内鸡油菌的遗传多样性,并为更好的保护和利用这类具有重要生态意义和经济价值的野生食用菌提供科学的依据。  目前研究取得了如下结果:  1、收集了云南省19个地区的426份鸡油菌标本,地理距离从西到东跨度了480千米,从南到北550千米。扩增了ITS(internal transcribed spacer regionof the ribosomal RNA gene,核糖体RNA的非转录间隔区),TEF1(thetranslation elongation factor1-alpha,转移延伸因子),RPB1(the largest subunitof RNA polymeraseⅠ,RNA聚合酶Ⅰ大亚基基因),ATP6(the mitochondrialATP synthase gene,线粒体ATP合成酶基因),和CHS1(Chitin synthase gene,几丁质合成酶基因)五个基因,其中除ITS外的四个基因位点作为群体遗传分析的分子标记。最后,我们扩增得到264条ITS序列,149条CHS1序列,153条RPB1序列,147条TEF1序列,及151条ATP6序列用于后续系统发育和群体遗传分析。  2、采用鸡油菌属系统分类比较认可的TEF1序列与相关种构建NJ树,发现我们的菌株主要分成了四个支系,大部分的样品聚集在第一支,靠近C.tenuithrix,第二支与C.lilacinopruinatus和C.amethysteus s.l.聚在一起,第三支靠近C.amethysteus,第四支离C.cinnabarinus较近,初步推断在我们的样品中至少存在四个隐存种。  3、对四个基因序列的单倍型分析发现,TEF1、CHS1、RPB1、ATP6基因的单倍型没有形成按地理来源的支系,不同的地理群体间有基因流存在。  4、对序列信息还进行了群体遗传学分析,Mantel检测显示,鸡油菌地理群体间遗传距离与地理距离之间无正相关关系。AMOVA分析发现自地理群体内的分子变化贡献最大,占了68%,其次,是来自不同的地理群体间的分子变化占了26%,在不同区域间为6%。生殖模式检测分析:哈迪温伯格平衡检测发现大部分群体中都有位点是符合哈迪温伯格平衡的,连锁系数分析也发现等位基因是存在连锁的,这都说明了重组在鸡油菌自然群体中起着很重要的作用。  5、经过对线粒体基因ATP6的分析,发现鸡油菌中存在线粒体重组,这是在大型真菌自然群体中少见的现象,在鸡油菌的自然群体中属首次发现。
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