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MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性的非编码RNA,它可以在转录后调控靶基因的表达水平。在我的学位论文中,我总结了自己在miRNAs研究中的两个工作,其一主要是采用计算生物学方法探讨miRNAs在信号通路中的作用;另一个是MicroRNA-153抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制研究。
哺乳动物miRNAs都倾向于聚集于染色体上,形成一簇miRNAs,但这种在哺乳动物中普遍存在的特性的生物功能意义尚未有人深入研究。在第一部分中我提出了一种预测受到miRNAs簇调控的信号通路的方法;并把该方法应用于预测受到miRNAs簇调控的小鼠信号通路,共发现了3个miRNAs簇可能调控15个信号通路。通过体外报告系统,实验证实了其中一个miRNAs簇,mmu-mir-183~96~182可以分别调控胰岛素信号通路上的Irs1,Rasa1和Grb2这三个靶基因。这个例子也说明了一簇miRNAs中的各个成员可以通过分别调控位于同一个信号通路上的靶基因从而协同地控制整个信号通路。
MicroRNA-153(miR-153)是脑组织特异表达的miRNA。和正常脑组织相比,它在神经胶质瘤中表达量显著下降,但它的下游靶基因和细胞作用机制都不清楚。在我的第二个工作中,在多型性胶质母细胞瘤细胞系DBTRG-05MG中,发现miR-153过表达可以抑制细胞增殖并引起细胞凋亡;生物信息学分析B-celllymphoma2(Bcl-2)和myeloid cell leukemia sequence1(Mcl-1)可能是它的靶基因。通过Westem blot和定量PCR方法发现,miR-153引起凋亡的分子机制部分是通过降低Bcl-2和Mcl-1的蛋白水平而不是mRNA水平。合成的单链miR-153的抑制剂可以和miR-153通过碱基配对形式结合,从而抑制了miR-153引起的Bcl-2和Mcl-1的蛋白水平降低以及细胞凋亡。而且,进一步利用体外报告系统发现miR-153作用在Bcl-2和Mcl-13UTR区域。以上证据表明,miR-153是控制神经胶质瘤细胞凋亡的一个调控基因。这个工作为下一步抗肿瘤药物开发奠定了基础。